RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592358.1

UBXN6-208, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 626 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-208ENST00000592358 VEGFDO43915 354 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 NPHS1O60500 1241 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 S100BP04271 92 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 PCCBP05166 539 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 TBC1D3HP0C7X1 549 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 NDUFV2P19404 249 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 AOAHP28039 575 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 PRLHRP49683 370 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 NFKB2Q00653 900 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 RCN2Q14257 317 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 TSNQ15631 228 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 MAP7D1Q3KQU3 841 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 CGB2Q6NT52 195 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 PNCKQ6P2M8 343 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 FRA10AC1Q70Z53 315 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 HORMAD1Q86X24 394 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 PGBD3Q8N328 593 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 OR6Y1Q8NGX8 325 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 HMGB4Q8WW32 186 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 ELMO1Q92556 727 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 RTKNQ9BST9 563 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 TRIM39Q9HCM9 518 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 A0A1W2PQU0 124 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 OR2AG2A6NM03 316 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 K7ESM1 405 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 EBAG9O00559 213 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 CDK14O94921 469 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 GSTM1P09488 218 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 MPC1LP0DKB6 136 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 GFAPP14136 432 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 GABRG2P18507 467 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 CCR7P32248 378 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 NAGLUP54802 743 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 NAA20P61599 178 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 GSTM4Q03013 218 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 OVGP1Q12889 678 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 ZSCAN26Q16670 478 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 BCL7AQ4VC05 210 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 SYTL3Q4VX76 610 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 ACSBG2Q5FVE4 666 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 TMEM220Q6QAJ8 160 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 FAM124AQ86V42 546 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 GPSM1Q86YR5 675 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 FBXO39Q8N4B4 442 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 CCNYL1Q8N7R7 359 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 ASB12Q8WXK4 309 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 CNDP1Q96KN2 507 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 DRC3Q9H069 523 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 CYP4F12Q9HCS2 524 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 NPHS2Q9NP85 383 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 NUDT4Q9NZJ9 180 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 CEP250Q9BV73 2442 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 CACNA1AO00555 2505 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 NEMP2A6NFY4 417 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 ERICH4A6NGS2 130 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 LRRC72A6NJI9 287 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 UBXN8O00124 270 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 RAD51BO15315 384 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 ITM2AO43736 263 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 SNX2O60749 519 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 IMPDH1P20839 514 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 IRF4Q15306 451 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 CES4AQ5XG92 561 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 NAPRTQ6XQN6 538 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 NEK10Q6ZWH5 1172 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 TRIM74Q86UV6 250 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 HEATR4Q86WZ0 1026 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 PELI3Q8N2H9 469 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN6-208ENST00000592358 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms