RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589298.2

APLP1-206, Transcript of amyloid beta precursor like protein 1, human

TSL 5

Gene APLP1, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APLP1-206	ENST00000589298	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	PLK5	Q496M5	336 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	ATG16L1	Q676U5	607 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	TTC23L	Q6PF05	361 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	DET1	Q7L5Y6	550 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	CEP97	Q8IW35	865 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	SNX19	Q92543	992 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	KLK6	Q92876	244 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	OLFM1	Q99784	485 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	OR2AG1	Q9H205	316 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	WASF3	Q9UPY6	502 aa		13.41	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	OR2AG2	A6NM03	316 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	METTL12	A8MUP2	240 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	GPR39	O43194	453 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	GRID2	O43424	1007 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	NUAK1	O60285	661 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	KDM1A	O60341	852 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	SOD1	P00441	154 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	RPN2	P04844	631 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	TPBGL	P0DKB5	382 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	MPC1L	P0DKB6	136 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	MYL2	P10916	166 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	CD27	P26842	260 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	ALDH3A1	P30838	453 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	BLK	P51451	505 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	CLCN7	P51798	805 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	PPP2CB	P62714	309 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	PPP2CA	P67775	309 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	RPA4	Q13156	261 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	NFATC4	Q14934	902 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	CLEC14A	Q86T13	490 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	IQCH	Q86VS3	1027 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	AMZ2	Q86W34	360 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	HM13	Q8TCT9	377 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	CD200R1	Q8TD46	325 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	MGARP	Q8TDB4	240 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	LINGO1	Q96FE5	620 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	WDR92	Q96MX6	357 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	RNF112	Q9ULX5	631 aa		13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
APLP1-206	ENST00000589298	MGAT4D	A6NG13	374 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	SLC16A5	O15375	505 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	PLIN3	O60664	434 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	SNX2	O60749	519 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	MTX2	O75431	263 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	C8G	P07360	202 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	CPA3	P15088	417 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	TFEB	P19484	476 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	CYP2A7	P20853	494 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	AOAH	P28039	575 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	IGFALS	P35858	605 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	CSRP3	P50461	194 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	B4GALNT1	Q00973	533 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	SP140	Q13342	867 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	LRP8	Q14114	963 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	PHC3	Q8NDX5	983 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		13.39	□□□□□ -0.27
APLP1-206	ENST00000589298	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.39	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms