RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4D1Q15615 310 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP7D1Q3KQU3 841 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ARMC12Q5T9G4 340 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 TCEAL6Q6IPX3 200 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 FRMD1Q8N878 549 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 TCEAL3Q969E4 200 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 BIRC8Q96P09 236 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ACOX2Q99424 681 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR41Q9HAD4 459 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM45AQ9NWC5 275 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 IL17CQ9P0M4 197 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 VPS51Q9UID3 782 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PKP3Q9Y446 797 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PQF6 199 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 BBIP1A8MTZ0 92 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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CAPNS1-204ENST00000587718 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.68e-7■■■■□ 23
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CAPNS1-204ENST00000587718 PLK1P53350 603 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 LCP2Q13094 533 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 CDH18Q13634 790 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPRNQ16849 979 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF423Q2M1K9 1284 aa25.06■■□□□ 1.6
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CAPNS1-204ENST00000587718 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa25.06■■□□□ 1.6
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM198Q66K66 360 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKS6Q68DC2 871 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PAQR3Q6TCH7 311 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 HPS6Q86YV9 775 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCA7Q8IZY2 2146 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO39Q8N4B4 442 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 HMGB4Q8WW32 186 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 C19orf60Q96EN9 201 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 EXOC2Q96KP1 924 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 TTC1Q99614 292 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ACSS2Q9NR19 701 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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CAPNS1-204ENST00000587718 RNF112Q9ULX5 631 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF711Q9Y462 761 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 AZIN1O14977 448 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 SNAP91O60641 907 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK14O94921 469 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PGLSO95336 258 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ME2P23368 584 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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CAPNS1-204ENST00000587718 STPG1Q5TH74 334 aa25.05■■□□□ 1.6
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CAPNS1-204ENST00000587718 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PDE5AO76074 875 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 MLYCDO95822 493 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 GFAPP14136 432 aa25.05■■□□□ 1.6
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CAPNS1-204ENST00000587718 DGKGP49619 791 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 STX1BP61266 288 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 KLC1Q07866 573 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PEX6Q13608 980 aa25.05■■□□□ 1.6
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CAPNS1-204ENST00000587718 GABRG3Q99928 467 aa25.05■■□□□ 1.6
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CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R36Q96LQ0 422 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR21Q99679 349 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 P2RY12Q9H244 342 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMD13Q9UNM6 376 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 SPTBN2O15020 2390 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM38O00635 465 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ADRB1P08588 477 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ABL2P42684 1182 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 WASP42768 502 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATS1Q496A3 300 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 COQ5Q5HYK3 327 aa25.03■■□□□ 1.6
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