RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	INPPL1	O15357	1258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CACNG3	O60359	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PLIN3	O60664	434 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BANF1	O75531	89 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NEBL	O76041	1014 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DDHD2	O94830	711 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	THRA	P10827	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CDK4	P11802	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CKB	P12277	381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP2B6	P20813	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPN3	P26045	913 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	EPHB2	P29323	1055 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINB3	P29508	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PLA2G5	P39877	138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	VHL	P40337	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC26A3	P40879	764 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MASP1	P48740	699 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CLCN2	P51788	898 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NDST2	P52849	883 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	LIMK2	P53671	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	AQP5	P55064	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	AP2B1	P63010	937 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HSD11B2	P80365	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	XIAP	P98170	497 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GAD2	Q05329	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BST1	Q10588	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GRIK3	Q13003	919 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR162	Q16538	588 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	UPP1	Q16831	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SERINC5	Q86VE9	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM228A	Q86W67	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	JADE3	Q92613	823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	VPS39	Q96JC1	886 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINB11	Q96P15	392 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINI1	Q99574	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RBBP8	Q99708	897 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNK13	Q9HB14	408 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ACOT9	Q9Y305	439 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HES2	Q9Y543	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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