RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRIT1Q9P2V4 623 aa32.45■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa32.44■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM16O95361 564 aa32.44■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDK4P11802 303 aa32.44■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 PNLIPP16233 465 aa32.44■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa32.44■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 NFU1Q9UMS0 254 aa32.44■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMD13Q9UNM6 376 aa32.44■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF215Q9Y6U7 377 aa32.44■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPEGQ15772 3267 aa32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 HAUS5O94927 633 aa32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 F7P08709 466 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35G4P0C7Q5 338 aa32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 PKMP14618 531 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPX6P59796 221 aa32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 HHEXQ03014 270 aa32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLCA4Q14CN2 919 aa32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT222Q8N1A0 295 aa32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC68Q9H2F9 335 aa32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPNE7Q9UBL6 633 aa32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPTBN2O15020 2390 aa32.43■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPAG6O75602 509 aa32.42■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGB6P18564 788 aa32.42■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCR7P32248 378 aa32.42■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC157Q569K6 752 aa32.42■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 PERM1Q5SV97 790 aa32.42■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC74AQ96AQ1 378 aa32.42■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 WWP1Q9H0M0 922 aa32.42■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 COMMD10Q9Y6G5 202 aa32.42■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52A4PA6NMU1 304 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHPN2P1A8MT19 583 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYTL3Q4VX76 610 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNSTQ6PJW8 725 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF438Q7Z4V0 828 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASZ1Q8WWH4 475 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52A5Q9H2C5 316 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 POT1Q9NUX5 634 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC17A6Q9P2U8 582 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC5A10A0PJK1 596 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 KPNA5O15131 536 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPM1DO15297 605 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC19A1P41440 591 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM48Q8IWZ4 208 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDKL2Q92772 493 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM159Q96B96 161 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC3Q9BQI4 270 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa32.41■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 NIPSNAP2O75323 286 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 AHSGP02765 367 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 AOAHP28039 575 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 GABRB3P28472 473 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDHA2P29803 388 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 PREPP48147 710 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 E2F1Q01094 437 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 NR1D2Q14995 579 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRD3Q15059 726 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 OTOAQ7RTW8 1153 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC26A11Q86WA9 606 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXorf40BQ96DE9 158 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 RABGEF1Q9UJ41 708 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 E5RI56 91 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 VIPP01282 170 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 APOA4P06727 396 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRM3P20309 590 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR3P46089 330 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPA14Q0VDF9 509 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPE65Q16518 533 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF549Q6P9A3 640 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAPRTQ6XQN6 538 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNJ9Q92806 393 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH3KBP1Q96B97 665 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 C12orf66Q96MD2 445 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 STX2P32856 288 aa32.38■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD151P48509 253 aa32.38■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMED2Q15363 201 aa32.38■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 RMDN2Q96LZ7 410 aa32.38■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPC4O75487 556 aa32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLMAPQ14BN4 828 aa32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 KYNUQ16719 465 aa32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms