RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
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CMTM4-204ENST00000563952 NSG1P42857 185 aa30.04■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 PRAMEP78395 509 aa30.04■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 CRADDP78560 199 aa30.04■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 ITIH4Q14624 930 aa30.04■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 PCID2Q5JVF3 399 aa30.04■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 IRGCQ6NXR0 463 aa30.04■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 COG1Q8WTW3 980 aa30.04■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 OSBPL9Q96SU4 736 aa30.04■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
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CMTM4-204ENST00000563952 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa30.04■■■□□ 2.4
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CMTM4-204ENST00000563952 CD82P27701 267 aa30.03■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 ACVR1Q04771 509 aa30.03■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 GPS1Q13098 491 aa30.03■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 KRT33BQ14525 404 aa30.03■■■□□ 2.4
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CMTM4-204ENST00000563952 ANKS6Q68DC2 871 aa30.03■■■□□ 2.4
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CMTM4-204ENST00000563952 GPR155Q7Z3F1 870 aa30.03■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 BMPERQ8N8U9 685 aa30.03■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 OR4L1Q8NH43 312 aa30.03■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 DDA1Q9BW61 102 aa30.03■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa30.03■■■□□ 2.4
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CMTM4-204ENST00000563952 DCAF12Q5T6F0 453 aa30.02■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa30.02■■■□□ 2.4
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CMTM4-204ENST00000563952 TTC1Q99614 292 aa30.02■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 CTRCQ99895 268 aa30.02■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 BFARQ9NZS9 450 aa30.02■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 SSUH2Q9Y2M2 353 aa30.02■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa30.02■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa30.02■■■□□ 2.4
CMTM4-204ENST00000563952 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa30.01■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 AP3B1O00203 1094 aa30.01■■■□□ 2.39
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CMTM4-204ENST00000563952 NPY2RP49146 381 aa30.01■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 SEPHS1P49903 392 aa30.01■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 MC2RQ01718 297 aa30.01■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 TPSAB1Q15661 275 aa30.01■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF449Q6P9G9 518 aa30.01■■■□□ 2.39
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CMTM4-204ENST00000563952 PACS1Q6VY07 963 aa30.01■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF534Q76KX8 674 aa30.01■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 PEX13Q92968 403 aa30.01■■■□□ 2.39
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CMTM4-204ENST00000563952 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa30.01■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 USP27XA6NNY8 438 aa30■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 STMND1H3BQB6 276 aa30■■■□□ 2.39
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CMTM4-204ENST00000563952 MGAT1P26572 445 aa30■■■□□ 2.39
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CMTM4-204ENST00000563952 PPP1CAP62136 330 aa30■■■□□ 2.39
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CMTM4-204ENST00000563952 CCDC81Q6ZN84 652 aa30■■■□□ 2.39
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CMTM4-204ENST00000563952 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa30■■■□□ 2.39
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CMTM4-204ENST00000563952 LRRC8BQ6P9F7 803 aa29.99■■■□□ 2.39
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CMTM4-204ENST00000563952 ACTRT1Q8TDG2 376 aa29.99■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 ZFPM2Q8WW38 1151 aa29.99■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 ELMO1Q92556 727 aa29.99■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 FERD3LQ96RJ6 166 aa29.99■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 APMAPQ9HDC9 416 aa29.99■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 SYBUQ9NX95 663 aa29.99■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
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CMTM4-204ENST00000563952 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 FTH1P02794 183 aa29.98■■■□□ 2.39
CMTM4-204ENST00000563952 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
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