RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 GAS8O95995 478 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 MLNP12872 115 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 SLC2A4P14672 509 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 IDSP22304 550 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 MPSTP25325 297 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 PDHA2P29803 388 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 NSG1P42857 185 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 PREPP48147 710 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 LSSP48449 732 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 EPHA4P54764 986 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 GFERP55789 205 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 PRAMEP78395 509 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 GUCA2AQ02747 115 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 C2orf54Q08AI8 447 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 GPR18Q14330 331 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 PPP1R7Q15435 360 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CTSL3PQ5NE16 218 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 NAPRTQ6XQN6 538 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 OR6P1Q8NGX9 317 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 HEXDCQ8WVB3 486 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 SLC38A3Q99624 504 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 P2RY12Q9H244 342 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 SLC40A1Q9NP59 571 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 BFARQ9NZS9 450 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 PDP2Q9P2J9 529 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 ASIC3Q9UHC3 531 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CDYLQ9Y232 598 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CACNA1GO43497 2377 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 SLC5A10A0PJK1 596 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 IQCF5A8MTL0 148 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 DUX1O43812 170 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 VAPBO95292 243 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 VIPP01282 170 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 C9P02748 559 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 POLBP06746 335 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 RALBP11234 206 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 CCL4P13236 92 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 TYRP1P17643 537 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 VCLP18206 1134 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 ITGB6P18564 788 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 ITIH1P19827 911 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 MAPK9P45984 424 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 CAPZBP47756 277 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 LIMK2P53671 638 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 GPLD1P80108 840 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 DR1Q01658 176 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 LAMB3Q13751 1172 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM71Q6P5X7 295 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 CENPUQ71F23 418 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM135Q86UB9 458 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 VRK3Q8IV63 474 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 UNC5BQ8IZJ1 945 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 KRT222Q8N1A0 295 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 OR4D9Q8NGE8 314 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 LPGAT1Q92604 370 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 C12orf66Q96MD2 445 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM74Q96NL1 305 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 KRT12Q99456 494 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 CCM2Q9BSQ5 444 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 MGAQ8IWI9 3026 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 KLHL33A6NCF5 533 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC33-211ENST00000563951 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms