RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, human

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-215	ENST00000557654	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ARL3	P36405	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	CAMP	P49913	170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	MMP15	P51511	669 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TUBB4B	P68371	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	MEP1A	Q16819	746 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	USP6NL	Q92738	828 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654		A0A087X0M5	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654		A0A1B0GX30	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	HS6ST1	O60243	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	GPC4	O75487	556 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TPPP	O94811	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TSHB	P01222	138 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	INHBA	P08476	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	CD48	P09326	243 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	CLTB	P09497	229 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM11	P17152	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	GABRB1	P18505	474 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PAX3	P23760	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TESK2	Q96S53	571 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	DDO	Q99489	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	IGHD	P01880	384 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	HADHA	P40939	763 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	CDH8	P55286	799 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	DCAF7	P61962	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	SYNJ2	O15056	1496 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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