RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551920.1

GCN1-209, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

TSL 3

Gene GCN1, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-209ENST00000551920 CAMK2BQ13554 666 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 AMZ1Q400G9 498 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 SPANXN3Q5MJ09 141 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 NKAIN2Q5VXU1 208 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 SLC9B2Q86UD5 537 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 CTAGE6Q86UF2 777 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 KCNMB4Q86W47 210 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 CTAGE4Q8IX94 777 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 GALNT15Q8N3T1 639 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 FBXO36Q8NEA4 188 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 MNS1Q8NEH6 495 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 LRRC39Q96DD0 335 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 NUDT22Q9BRQ3 303 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 NAT9Q9BTE0 207 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 VPS37BQ9H9H4 285 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 RDH14Q9HBH5 336 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 POT1Q9NUX5 634 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.01■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 SLC5A10A0PJK1 596 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 QSOX1O00391 747 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 CSO75390 466 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 TCEA3O75764 348 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 SLC35G4P0C7Q5 338 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 HALP42357 657 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 PLTPP55058 493 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 BIRC2Q13490 618 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 SPIDRQ14159 915 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 GPR18Q14330 331 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 BRD3Q15059 726 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 VRK3Q8IV63 474 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 ELMO1Q92556 727 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 CXorf40BQ96DE9 158 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 CERS2Q96G23 380 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 C12orf66Q96MD2 445 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 TCF12Q99081 682 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 CARD6Q9BX69 1037 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 FOXP3Q9BZS1 431 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 KCNK4Q9NYG8 393 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 CDYLQ9Y232 598 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 MSRB2Q9Y3D2 182 aa16■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 LILRA5A6NI73 299 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 NDC80O14777 642 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 NIPSNAP2O75323 286 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 VIPP01282 170 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 GSTM1P09488 218 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 JUPP14923 745 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 FMO4P31512 558 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 ADARP55265 1226 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 FOXK2Q01167 660 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 GUCY2DQ02846 1103 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 GSTM4Q03013 218 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 RPA4Q13156 261 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 ISXQ2M1V0 245 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 TMEM26Q6ZUK4 368 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 PDZD3Q86UT5 571 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 LRRC6Q86X45 466 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 TRIM48Q8IWZ4 208 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 ZBED8Q8IZ13 594 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 WDR48Q8TAF3 677 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 GATA6Q92908 595 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 FAM136AQ96C01 138 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 SLC38A3Q99624 504 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 FAM167BQ9BTA0 163 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 UCK1Q9HA47 277 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 OGFRQ9NZT2 677 aa15.99■□□□□ 0.15
GCN1-209ENST00000551920 TMEM9Q9P0T7 183 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms