RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PRSS42Q7Z5A4 293 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 USP37Q86T82 979 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CUZD1Q86UP6 607 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM228AQ86W67 206 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 NUDT13Q86X67 352 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PLXDC1Q8IUK5 500 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 C1orf210Q8IVY1 113 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HACE1Q8IYU2 909 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CRYBG2Q8N1P7 616 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 GHDCQ8N2G8 530 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC25A41Q8N5S1 370 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 EXD1Q8NHP7 514 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 IL17DQ8TAD2 202 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TBC1D15Q8TC07 691 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC20A1Q8WUM9 679 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CKAP2Q8WWK9 683 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PIBF1Q8WXW3 757 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 FAR2Q96K12 515 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 NECTIN4Q96NY8 510 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 QRFPRQ96P65 431 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 KLHL5Q96PQ7 755 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PANX2Q96RD6 677 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CYTH2Q99418 400 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PAAF1Q9BRP4 392 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 C11orf70Q9BRQ4 267 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HAUS8Q9BT25 410 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 H2AFJQ9BTM1 129 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 AMNQ9BXJ7 453 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC46A2Q9BY10 475 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 OR10A2Q9H208 303 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 P2RY12Q9H244 342 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CENPHQ9H3R5 247 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 LDAHQ9H6V9 325 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 MINDY3Q9H8M7 445 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 GLOD4Q9HC38 313 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 GPR35Q9HC97 309 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TREM1Q9NP99 234 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PANK4Q9NVE7 773 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 OR6C3Q9NZP0 311 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 VPS54Q9P1Q0 977 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PEMTQ9UBM1 199 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PLAGL1Q9UM63 463 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CDC14AQ9UNH5 594 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PLA2G4CQ9UP65 541 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 MGAT4BQ9UQ53 548 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CHMP2BQ9UQN3 213 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CMAHPQ9Y471 501 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PTCH1Q13635 1447 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa3.5□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A0G2JNJ9 132 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A1W2PN81 502 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HELTA6NFD8 242 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 C5orf52A6NGY3 159 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 OR6C75A6NL08 312 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF785A8K8V0 405 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 AHRRA9YTQ3 701 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 USP17L23D6RBM5 183 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 DNAJB6O75190 326 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC43A1O75387 559 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 GCATO75600 419 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CELF2O95319 508 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 RHOP08100 348 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CHRM4P08173 479 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ANPEPP15144 967 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CKMT2P17540 419 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP2B6P20813 491 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP6V1C1P21283 382 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 MSR1P21757 451 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 MGAT1P26572 445 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SERPINB6P35237 376 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 THBS4P35443 961 aa3.49□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIM23P36406 574 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms