RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 FFAR3O14843 346 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 AREL1O15033 823 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 GPR42O15529 346 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PEX11AO75192 247 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RASSF9O75901 435 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PAPLNO95428 1278 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 GM2AP17900 193 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 AOC1P19801 751 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PGM1P36871 562 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MTHFRP42898 656 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CUL3Q13618 768 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SYTL3Q4VX76 610 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SGO1Q5FBB7 561 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CYHR1Q6ZMK1 362 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SYVN1Q86TM6 617 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FAM124AQ86V42 546 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SNX32Q86XE0 403 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 DTD2Q96FN9 168 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SLC45A3Q96JT2 553 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ATG10Q9H0Y0 220 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 IPPKQ9H8X2 491 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CCDC167Q9P0B6 97 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ZNF225Q9UK10 706 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SPEGQ15772 3267 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 K7EQS6 105 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ARNTLO00327 626 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 UBDO15205 165 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 GSC2O15499 205 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PCCBP05166 539 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 EZRP15311 586 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HIST1H2ADP20671 130 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CD9P21926 228 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 AOAHP28039 575 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PDHA2P29803 388 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TCEA2Q15560 299 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CST6Q15828 149 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 AADATQ8N5Z0 425 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PLA2G15Q8NCC3 412 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 OR9I1Q8NGQ6 314 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 METTL6Q8TCB7 284 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ASZ1Q8WWH4 475 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TMEM159Q96B96 161 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HIST1H2AJQ99878 128 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 H2AFJQ9BTM1 129 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SCAMP1O15126 338 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ENTPD5O75356 428 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PIK3R1P27986 724 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CTHP32929 405 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 DRD3P35462 400 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 KIF19Q2TAC6 998 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 UGT3A2Q3SY77 523 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FAM13CQ8NE31 585 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 DDHD1Q8NEL9 900 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 OR56A4Q8NGH8 313 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 OR14C36Q8NHC7 312 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 AGAP11Q8TF27 550 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MSLNLQ96KJ4 702 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NUDT4Q9NZJ9 180 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PDE10AQ9Y233 779 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 H0Y3Z8 333 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 STX16O14662 325 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CFLARO15519 480 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms