RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	GLP2R	O95838	553 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	MSH3	P20585	1137 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71	8e-7	■■■□□ 15.6
CTSC-208	ENST00000533897	ETFB	P38117	255 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	SGSH	P51688	502 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	CAP1	Q01518	475 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	GPNMB	Q14956	572 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	RNF135	Q8IUD6	432 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	ALG14	Q96F25	216 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	CGREF1	Q99674	301 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	PITX2	Q99697	317 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897		A0A0D9SEW6	157 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	KDELR3	O43731	214 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	G6PD	P11413	515 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	AGXT	P21549	392 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	GGT5	P36269	586 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	OPRL1	P41146	370 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	CD47	Q08722	323 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	GALNT3	Q14435	633 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	CYGB	Q8WWM9	190 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	FANCE	Q9HB96	536 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	LHX3	Q9UBR4	397 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	SLC1A7	O00341	560 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	DFNA5	O60443	496 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	ARHGEF15	O94989	841 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	PFKL	P17858	780 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	IL10	P22301	178 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	FSHR	P23945	695 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	DCT	P40126	519 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	MTAP	Q13126	283 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	IL18R1	Q13478	541 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	E2F2	Q14209	437 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	PTPRR	Q15256	657 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	GIPC3	Q8TF64	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	SEMA3C	Q99985	751 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	NTMT1	Q9BV86	223 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CTSC-208	ENST00000533897	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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