RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 EFCAB8A8MWE9 144 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 BRINP1O60477 761 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 USP1O94782 785 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 UBXN7O94888 489 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 CAPNS1P04632 268 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 CSF2RBP32927 897 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 GPR18Q14330 331 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 KRT33BQ14525 404 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 SYTL3Q4VX76 610 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 MAATS1Q7Z4T9 603 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM135Q86UB9 458 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC6Q86X45 466 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 PROSER1Q86XN7 944 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 CMKLR1Q99788 373 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 FAM187AA6NFU0 413 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 TUBB4AP04350 444 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 OGNP20774 298 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 ARNTP27540 789 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 NDUFS1P28331 727 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 CD151P48509 253 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 CFHR1Q03591 330 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 PLCL1Q15111 1095 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 XKR5Q6UX68 686 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 GPR150Q8NGU9 434 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 ZFPM2Q8WW38 1151 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC74BQ96LY2 380 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 TCF12Q99081 682 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 CARD6Q9BX69 1037 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM31Q9BZY9 425 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 LOXL2Q9Y4K0 774 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRK-222ENST00000532751 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 GOLGA8KD6RF30 607 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 GOLGA8TH3BQL2 631 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 PLD2O14939 933 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 HGSO14964 777 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 DXOO77932 396 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 JMJD7P0C870 316 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 THRAP10827 490 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 PGAM1P18669 254 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 ITGA8P53708 1063 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 C2orf54Q08AI8 447 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 NEPROQ6NW34 567 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 KLHL35Q6PF15 583 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 IGF2-ASQ6U949 168 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 PLXDC1Q8IUK5 500 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 PDIK1LQ8N165 341 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 BBOF1Q8ND07 529 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 PANX3Q96QZ0 392 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 NAT9Q9BTE0 207 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 OR52A5Q9H2C5 316 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 TYRP1P17643 537 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 MPSTP25325 297 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 PREPP48147 710 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 LONRF1Q17RB8 773 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 TYSND1Q2T9J0 566 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 BBS9Q3SYG4 887 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 LMNTD2Q8IXW0 634 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 CALML6Q8TD86 181 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF592Q92610 1267 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 THSD1Q9NS62 852 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM9Q9P0T7 183 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRK-222ENST00000532751 PDP2Q9P2J9 529 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms