RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	NFATC4	Q14934	902 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	C12orf60	Q5U649	245 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	RGMB	Q6NW40	437 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	KLHL35	Q6PF15	583 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ESR2	Q92731	530 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	PERP	Q96FX8	193 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ADGRG7	Q96K78	797 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ACOX2	Q99424	681 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SYNC	Q9H7C4	482 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	5	□□□□□ -1.61	5e-22	■■■■■ 43.6
RPS13-208	ENST00000531908	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CFAP45	Q9UL16	551 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	VDAC3	Q9Y277	283 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	DOCK2	Q92608	1830 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	MYH7	P12883	1935 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CACNA1S	Q13698	1873 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ERICH2	A1L162	156 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908		H0YIN7	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	HS3ST1	O14792	307 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SPINT2	O43291	252 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	RFPL2	O75678	378 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	FTCD	O95954	541 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	EGF	P01133	1207 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ACTN1	P12814	892 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF12	P17014	697 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	TROAP	Q12815	778 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	WTAP	Q15007	396 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61	2e-26	■■■■□ 24.3
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	DCST1	Q5T197	706 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	RND1	Q92730	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	NID2	Q14112	1375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	GAK	O14976	1311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	FIBP	O43427	364 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CLDN14	O95500	239 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	RARG	P13631	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61	1e-6	■■■■□ 19.8
RPS13-208	ENST00000531908	FASLG	P48023	281 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	PDE1B	Q01064	536 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	DLG1	Q12959	904 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SNTA1	Q13424	505 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	OLFM4	Q6UX06	510 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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