RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514267.1

CALCOCO2-223, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 2

Gene CALCOCO2, Length 336 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-223	ENST00000514267	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	THAP6	Q8TBB0	222 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CORO2A	Q92828	525 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	INPP5D	Q92835	1189 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PTP4A1	Q93096	173 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SLAMF9	Q96A28	289 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ORAI1	Q96D31	301 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SEPHS2	Q99611	448 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	GFI1	Q99684	422 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	FUT8	Q9BYC5	575 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	DCLK3	Q9C098	648 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ISCU	Q9H1K1	167 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	FZD10	Q9ULW2	581 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267		A0A0B4J293	547 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267		A0A1W2PPC1	479 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	OOEP	A6NGQ2	149 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ENO4	A6NNW6	628 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	DVL1	O14640	695 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SLC30A4	O14863	429 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ASAP2	O43150	1006 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SPRY3	O43610	288 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PLPP2	O43688	288 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SSX4	O60224	188 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ZNF217	O75362	1048 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	MED24	O75448	989 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	GAGE7	O76087	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	TOMM70	O94826	608 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CYP1A2	P05177	515 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	GAGE12F	P0CL80	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	GAGE12G	P0CL81	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	GAGE12I	P0CL82	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ADRA2C	P18825	462 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	KCNA5	P22460	613 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ITGB8	P26012	769 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	TAS2R38	P59533	333 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PPP2R2B	Q00005	443 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	UBXN1	Q04323	297 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	GAGE1	Q13065	139 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	GAGE4	Q13068	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	GPR18	Q14330	331 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CTF1	Q16619	201 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ZNF534	Q76KX8	674 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	WASF1	Q92558	559 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	EXT2	Q93063	718 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	MIB2	Q96AX9	1013 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SPSB1	Q96BD6	273 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	MED30	Q96HR3	178 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ZNF479	Q96JC4	524 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SEMA3C	Q99985	751 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	KXD1	Q9BQD3	176 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SNX7	Q9UNH6	387 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ARAP1	Q96P48	1450 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-223	ENST00000514267		A0A1W2PPM1	405 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-223	ENST00000514267	C4orf47	A7E2U8	309 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CLDN4	O14493	209 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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