RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF534	Q76KX8	674 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRELID2	Q8N945	189 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC39A7	Q92504	469 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC45	Q96CN5	670 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	C12orf66	Q96MD2	445 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	RANBP9	Q96S59	729 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	NRTN	Q99748	197 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	COG4	Q9H9E3	785 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAK5	Q9P286	719 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEP104	O60308	925 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	DLGAP3	O95886	979 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLB	P06746	335 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	APRT	P07741	180 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	RALB	P11234	206 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEPHS1	P49903	392 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	RHD	Q02161	417 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEMA3A	Q14563	771 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	PACS1	Q6VY07	963 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	HDAC10	Q969S8	669 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	HEATR9	A2RTY3	570 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR5K3	A6NET4	321 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFAP99	D6REC4	459 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	TK2	O00142	265 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR1I1	O60431	355 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAD1	O60671	282 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF28	P17035	718 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADRA1D	P25100	572 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITIH4	Q14624	930 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	MANEA	Q5SRI9	462 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRGC	Q6NXR0	463 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC27	Q6P3X3	843 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC89	Q8N998	374 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF31	Q96EP0	1072 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	WBP1	Q96G27	269 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	SGSM3	Q96HU1	749 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	MS4A14	Q96JA4	679 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPM1M	Q96MI6	270 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014		E7EVH7	732 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	STK17B	O94768	372 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP2A2	O94973	939 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIF	P15018	202 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	NSG1	P42857	185 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	PREP	P48147	710 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRADD	P78560	199 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00303	Q3SY05	128 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	PEX13	Q92968	403 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		12.38	□□□□□ -0.43

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