RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	GAS8	O95995	478 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	IFNB1	P01574	187 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	PLA2G2A	P14555	144 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ETS1	P14921	441 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	LIF	P15018	202 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	GFER	P55789	205 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	XIAP	P98170	497 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	PLCL1	Q15111	1095 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	RPE65	Q16518	533 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	BORA	Q6PGQ7	559 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	NXPE1	Q8N323	547 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	COG1	Q8WTW3	980 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	PMEPA1	Q969W9	287 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	PDE7B	Q9NP56	450 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	SNX12	Q9UMY4	172 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464		F8W8V4	182 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	AP2A1	O95782	977 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	DLGAP3	O95886	979 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	FGF5	P12034	268 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	STAT5A	P42229	794 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	PRLHR	P49683	370 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ACY1	Q03154	408 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	FOXM1	Q08050	763 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	NFE2L1	Q14494	772 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	SPARCL1	Q14515	664 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	TBR1	Q16650	682 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	LINC00303	Q3SY05	128 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	IRGC	Q6NXR0	463 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	OOSP2	Q86WS3	158 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	STYX	Q8WUJ0	223 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	RSC1A1	Q92681	617 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	EXTL1	Q92935	676 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	CTRC	Q99895	268 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM117A	Q9C073	453 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	OR5K3	A6NET4	321 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	TLCD2	A6NGC4	264 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464		J3QKU1	62 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	CES2	O00748	559 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF185	O15231	689 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	FANCG	O15287	622 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	GPR39	O43194	453 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	LDB2	O43679	373 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	RECK	O95980	971 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	MC4R	P32245	332 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	FDFT1	P37268	417 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	KCNJ1	P48048	391 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	ARL4D	P49703	201 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	RPA4	Q13156	261 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	SEMA5A	Q13591	1074 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	TTC27	Q6P3X3	843 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	DET1	Q7L5Y6	550 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	CCDC89	Q8N998	374 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	OR8K5	Q8NH50	307 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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