RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EI24O14681 340 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AZIN1O14977 448 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARPC2O15144 300 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BAIAP3O94812 1187 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ODC1P11926 461 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GFAPP14136 432 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CD52P31358 61 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FMO4P31512 558 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UFM1P61960 85 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF33AQ06730 810 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MERTKQ12866 999 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LPIN1Q14693 890 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MIB1Q86YT6 1006 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BVESQ8NE79 360 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SGCDQ92629 289 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TOP1MTQ969P6 601 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ISOC1Q96CN7 298 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRRC58Q96CX6 371 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC126Q96EE4 140 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HBEGFQ99075 208 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SEPHS2Q99611 448 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IER2Q9BTL4 223 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADI1Q9BV57 179 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SP110Q9HB58 689 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KRBA1A5PL33 1030 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 H0YJX3 145 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDC7O00311 574 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PLD2O14939 933 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANGPT2O15123 496 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SUPT3HO75486 399 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SNAP29O95721 258 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM163BP0C2L3 166 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC2A3P11169 496 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FDXRP22570 491 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IL12AP29459 219 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GSK3BP49841 420 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LBX1P52954 281 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EFEMP1Q12805 493 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RPS6KA2Q15349 733 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CYP51A1Q16850 503 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPR107Q5VW38 600 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FBXL22Q6P050 247 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MIER2Q8N344 545 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LZTR1Q8N653 840 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NAT16Q8N8M0 369 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CALML6Q8TD86 181 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SEMA3CQ99985 751 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms