RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 C1orf74Q96LT6 269 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 FEM1AQ9BSK4 669 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 NANOGQ9H9S0 305 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 SOCS2O14508 198 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 GABBR2O75899 941 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 PRSS56P0CW18 603 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 GABRB3P28472 473 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ENTPD1P49961 510 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ATP4BP51164 291 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 RPS14P62263 151 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 FOXM1Q08050 763 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 GK3PQ14409 553 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 TGFBIQ15582 683 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 C6orf136Q5SQH8 315 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 KCNN1Q92952 543 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ERLEC1Q96DZ1 483 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 COX4I2Q96KJ9 171 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 EBPLQ9BY08 206 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 PALMDQ9NP74 551 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 SPG21Q9NZD8 308 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 A0A1B0GVG6 124 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 SUV39H1O43463 412 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 SNAP29O95721 258 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 IL6P05231 212 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 VARSP26640 1264 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 GABRR2P28476 465 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 PSMD7P51665 324 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 OR4D1Q15615 310 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 SULT1C3Q6IMI6 304 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 PAGE2Q7Z2X7 111 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 AMER2Q8N7J2 671 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 PYCR2Q96C36 320 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 NUAK2Q9H093 628 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 USP3Q9Y6I4 520 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 PDZK1P1A8MUH7 402 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 H3BNH8 94 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 EPOP01588 193 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 Q9Y3F1 56 aa13.06□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 FAM220BPB1ANY3 271 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 NME4O00746 187 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 TRBC1P01850 177 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ITGB1P05556 798 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 FYNP06241 537 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ARSAP15289 507 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 PPP4R4Q6NUP7 873 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 POC5Q8NA72 575 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 RAB2BQ8WUD1 216 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 SMOXQ9NWM0 555 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 J3QRK9 145 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 K7EPI3 171 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 FPGTO14772 594 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 GJA5P36382 358 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ARMC4Q5T2S8 1044 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 DOK6Q6PKX4 331 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 AHSA2Q719I0 299 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 CLEC14AQ86T13 490 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ATL1Q8WXF7 558 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 FBXL8Q96CD0 374 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 SLC45A3Q96JT2 553 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 DNAJC11Q9NVH1 559 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 PPP6CO00743 305 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ARHGEF9O43307 516 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 MAGP20916 626 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 CYP4Z1Q86W10 505 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 TMIGD2Q96BF3 282 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 PTERQ96BW5 349 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 HIPK3Q9H422 1215 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 EXD2Q9NVH0 621 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 CD84Q9UIB8 345 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 TRIM24O15164 1050 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 KRT75O95678 551 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 IL7RP16871 459 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 CAPN3P20807 821 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 MYBPC1Q00872 1141 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 CHIT1Q13231 466 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 SPANXN4Q5MJ08 99 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 KIAA0319Q5VV43 1072 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 KCTD11Q693B1 232 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ERAP2Q6P179 960 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 CASP12Q6UXS9 341 aa13.05□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 UTS2BQ765I0 119 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms