RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 PRKG2Q13237 762 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 XRCC4Q13426 336 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 TUBB3Q13509 450 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 IL10RAQ13651 578 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 POU6F1Q14863 301 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 SPA17Q15506 151 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 METRNLQ641Q3 311 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 TRIM73Q86UV7 250 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 DPYSL5Q9BPU6 564 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 CLMPQ9H6B4 373 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 PLAAQ9Y263 795 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 PKP3Q9Y446 797 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 RELNP78509 3460 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC66A2RUB6 948 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 OR5K3A6NET4 321 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 HACD1B0YJ81 288 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 GPR89AB7ZAQ6 455 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 PPFIA2O75334 1257 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 EPOP01588 193 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 GPR89BP0CG08 455 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 TPBGLP0DKB5 382 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 FGF5P12034 268 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 CTNNA2P26232 953 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 HALP42357 657 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 CCR10P46092 362 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 LMAN1P49257 510 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 GEMP55040 296 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 MLLT10P55197 1068 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 KCNC4Q03721 635 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 DMPKQ09013 629 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 ABHD18Q0P651 414 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 GPS2Q13227 327 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 SEPT6Q14141 434 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 SEMA3AQ14563 771 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 KCTD11Q693B1 232 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 PRSS42Q7Z5A4 293 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 OR2L2Q8NH16 312 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF778Q96MU6 729 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 SPATA13Q96N96 652 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 HGH1Q9BTY7 390 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 TRABDQ9H4I3 376 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 ACTL8Q9H568 366 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 UCK1Q9HA47 277 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 RAD18Q9NS91 495 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 LUZP4Q9P127 313 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 CRLS1Q9UJA2 301 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 TRHDEQ9UKU6 1024 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 PIPSLA2A3N6 862 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 MGAT4DA6NG13 374 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 BTN3A1O00481 513 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 MTSS1O43312 755 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 OR1I1O60431 355 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 SPTBP11277 2137 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 ST6GAL1P15907 406 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 PTMSP20962 102 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 VAV2P52735 878 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 TERF1P54274 439 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 RWDD2BP57060 319 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 SNX1Q13596 522 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 DNASE1L3Q13609 305 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 LAMB3Q13751 1172 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 ITGA9Q13797 1035 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 GSE1Q14687 1217 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 DBN1Q16643 649 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC3-211ENST00000491581 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.67□□□□□ -1.02
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