RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	VMP1	Q96GC9	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	EGFL8	Q99944	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ABCC5	O15440	1437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	NOS1	P29475	1434 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	URAD	A6NGE7	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	NDUFS7	O75251	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PSG1	P11464	419 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	HOXB2	P14652	356 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	IFNAR1	P17181	557 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PTAFR	P25105	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PCGF2	P35227	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PEX5	P50542	639 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PGGT1B	P53609	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CTSC	P53634	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	KRT83	P78385	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RBP5	P82980	135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PDE1B	Q01064	536 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	HNF4G	Q14541	408 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	NR1D2	Q14995	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	KRT39	Q6A163	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	C11orf88	Q6PI97	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ADCY9	O60503	1353 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ABCA3	Q99758	1704 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541		A0A1B0GVT2	93 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541		H3BNX3	289 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541		J3QR06	171 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SOCS6	O14544	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PLPP2	O43688	288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF217	O75362	1048 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TADA2A	O75478	443 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	KCNK5	O95279	499 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	HOXC6	P09630	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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