RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP7D3Q8IWC1 876 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC4A11Q8NBS3 891 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 GRK7Q8WTQ7 553 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC38A5Q8WUX1 472 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 PIGTQ969N2 578 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 MTERF3Q96E29 417 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM81BQ96LP2 452 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 OR1F2PQ96R84 312 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 INTS14Q96SY0 518 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 PCYT2Q99447 389 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 FNDC11Q9BVV2 318 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 FZD8Q9H461 694 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1W2PPQ1 181 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM178BH3BS89 294 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 OR10H2O60403 315 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 TOMM40O96008 361 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP11B2P19099 503 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC9A3P48764 834 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 ASCL1P50553 236 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 PGGT1BP53609 377 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 COG7P83436 770 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 TROAPQ12815 778 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 TRAF2Q12933 501 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 PLA2G7Q13093 441 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 NFE2L1Q14494 772 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 CALCRLQ16602 461 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 MEP1BQ16820 701 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 XKR9Q5GH70 373 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SFMBT2Q5VUG0 894 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR27Q6MZM9 219 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 TLK2Q86UE8 772 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 FJX1Q86VR8 437 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 TIGD4Q8IY51 512 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 OR52I2Q8NH67 350 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 FIBINQ8TAL6 211 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFAND2BQ8WV99 257 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SMPDL3BQ92485 455 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 C3orf30Q96M34 536 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SFXN2Q96NB2 322 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SLA2Q9H6Q3 261 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL9Q9P2J3 617 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SNX7Q9UNH6 387 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 LIPT1Q9Y234 373 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SNX5Q9Y5X3 404 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 A4D1N5 150 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 OR5K3A6NET4 321 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 C15orf62A8K5M9 175 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD66B4E2M5 251 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 MEIS2O14770 477 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 MID1O15344 667 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 LDLRP01130 860 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM58BPP0C7Q3 252 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 PSMA3P25788 255 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 TMPOP42166 694 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 BNC1Q01954 994 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 LEXMQ3ZCV2 418 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 NHSL2Q5HYW2 709 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SHEQ5VZ18 495 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM91A1Q658Y4 838 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 IYDQ6PHW0 289 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATA21Q7Z572 469 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 CEP57L1Q8IYX8 460 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 C1orf87Q8N0U7 546 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 ATAD1Q8NBU5 361 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 TANKQ92844 425 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 MOB3AQ96BX8 217 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 HES6Q96HZ4 224 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 CPNE1Q99829 537 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 INPP5KQ9BT40 448 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 FUT8Q9BYC5 575 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 NPAP1Q9NZP6 1156 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SIX4Q9UIU6 781 aa4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms