RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468069.1

RPS6KC1-203, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KC1, Length 784 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-203ENST00000468069 MAPK10P53779 464 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 CCL7P80098 99 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 MALLQ13021 153 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 SGCGQ13326 291 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC12A1Q13621 1099 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 FGL2Q14314 439 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 RABGAP1LQ5R372 815 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 MANEAQ5SRI9 462 aa5.66□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF529Q6P280 563 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 HTR3CQ8WXA8 447 aa5.66□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC25A18Q9H1K4 315 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.66□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 VANGL2Q9ULK5 521 aa5.66□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 ITM2BQ9Y287 266 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.66□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 D6RAR5 112 aa5.65□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 YY2O15391 372 aa5.65□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 RABIFP47224 123 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 THOP1P52888 689 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 PLK1P53350 603 aa5.65□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 HSD11B2P80365 405 aa5.65□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 CNGA2Q16280 664 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 LRRC73Q5JTD7 316 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 FAXCQ5TGI0 409 aa5.65□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 SCML4Q8N228 414 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 OR6K2Q8NGY2 324 aa5.65□□□□□ -1.5
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RPS6KC1-203ENST00000468069 STRADBQ9C0K7 418 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 CLPBQ9H078 707 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 DDIT4Q9NX09 232 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 FOXJ2Q9P0K8 574 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 SEPT10Q9P0V9 454 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 SPASTQ9UBP0 616 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 IL36AQ9UHA7 158 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5.65□□□□□ -1.5
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