RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PSMD11O00231 422 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FFAR2O15552 330 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF4O60810 478 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LILRB5O75023 590 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 VPS4BO75351 444 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TULP3O75386 442 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SUPT3HO75486 399 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GPC4O75487 556 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PDE5AO76074 875 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 AP2A2O94973 939 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MLYCDO95822 493 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MPC1LP0DKB6 136 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ADH5P11766 374 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GFAPP14136 432 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ANPEPP15144 967 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CAPN3P20807 821 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 DGKAP23743 735 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 VHLP40337 213 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 VIPR2P41587 438 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 HTR6P50406 440 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NUDT2P50583 147 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MS4A2Q01362 244 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SEMG2Q02383 582 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FCHO2Q0JRZ9 810 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GPM6BQ13491 265 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ENPP2Q13822 863 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RCAN2Q14206 197 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 E2F2Q14209 437 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA0040Q15053 153 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TLR1Q15399 786 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GSTA3Q16772 222 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF805Q5CZA5 627 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO48Q5FWF7 155 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf10Q5SRN2 563 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SULT1C3Q6IMI6 304 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TTC23LQ6PF05 361 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf89Q6UX73 402 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NEK10Q6ZWH5 1172 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF765Q7L2R6 523 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CYP2U1Q7Z449 544 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA19Q7Z5L4 167 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TRAM1L1Q8N609 369 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB2Q8N680 514 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 OR56A4Q8NGH8 313 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 OR9I1Q8NGQ6 314 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ASB11Q8WXH4 323 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SORCS1Q8WY21 1168 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ING5Q8WYH8 240 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 JADE3Q92613 823 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 EXT2Q93063 718 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R36Q96LQ0 422 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 VPS35Q96QK1 796 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FAM129BQ96TA1 746 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 COPS8Q99627 209 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CCT7Q99832 543 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A23Q9BV35 468 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NTMT1Q9BV86 223 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SLC12A9Q9BXP2 914 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CD244Q9BZW8 370 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LMAN2LQ9H0V9 348 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM245Q9H330 911 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MTG2Q9H4K7 406 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 WDR41Q9HAD4 459 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 EFCAB1Q9HAE3 211 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NMRK1Q9NWW6 199 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NDE1Q9NXR1 346 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 KCTD5Q9NXV2 234 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ASIC5Q9NY37 505 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM181Q9P2C4 612 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 STOML1Q9UBI4 398 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GULP1Q9UBP9 304 aa5.55□□□□□ -1.52
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