RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa23.14■■□□□ 1.3
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HOXB3-202ENST00000460160 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC162PA2VCL2 907 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 GAS8O95995 478 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 KCNJ1P48048 391 aa23.13■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 CTRCQ99895 268 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 RAB33BQ9H082 229 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 APMAPQ9HDC9 416 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 RIMKLBQ9ULI2 386 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 FOXN2P32314 431 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 MANEAQ5SRI9 462 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 TSTD2Q5T7W7 516 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 PRSS42Q7Z5A4 293 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF778Q96MU6 729 aa23.13■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa23.13■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 LAMB3Q13751 1172 aa23.12■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 CEACAM20Q6UY09 585 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 FAM92BQ6ZTR7 304 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 GSTA5Q7RTV2 222 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 PRELID2Q8N945 189 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 NKD1Q969G9 470 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 HDAC10Q969S8 669 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 ZDHHC12Q96GR4 267 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 COG4Q9H9E3 785 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 VPS37BQ9H9H4 285 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 TCAF1Q9Y4C2 921 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 BAHCC1Q9P281 2608 aa23.11■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 AP2A2O94973 939 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 SEPHS1P49903 392 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 ACVR1Q04771 509 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 ITIH4Q14624 930 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 C4orf22Q6V702 233 aa23.11■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 ZFPM2Q8WW38 1151 aa23.11■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 OR52A5Q9H2C5 316 aa23.11■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 KLHL35Q6PF15 583 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 AFTPHQ6ULP2 937 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 KLHL6Q8WZ60 621 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.1■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 ZNF462Q96JM2 2506 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 SH3BP2P78314 561 aa23.09■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 GSE1Q14687 1217 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF534Q76KX8 674 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 NLRP9Q7RTR0 991 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 REXO1L1PQ8IX06 675 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 SLC39A7Q92504 469 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 TTC9Q92623 222 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 PEX13Q92968 403 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 SEMA5BQ9P283 1151 aa23.09■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 OR5K3A6NET4 321 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 PDHA2P29803 388 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 ATP1A2P50993 1020 aa23.08■■□□□ 1.29
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HOXB3-202ENST00000460160 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 SPTBP11277 2137 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXB3-202ENST00000460160 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 TK2O00142 265 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 RAD1O60671 282 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 GSTM1P09488 218 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 PREPP48147 710 aa23.08■■□□□ 1.28
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