RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458646.1

RARB-204, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARB, Length 2,590 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-204ENST00000458646 NRIP1P48552 1158 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 MASP1P48740 699 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 RAD51Q06609 339 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PWP1Q13610 501 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 INAVAQ3KP66 663 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SPESP1Q6UW49 350 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 GPR142Q7Z601 462 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 TLK2Q86UE8 772 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SVOPLQ8N434 492 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 FIG4Q92562 907 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 YIPF6Q96EC8 236 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 NODALQ96S42 347 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PDFQ9HBH1 243 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 M0QZQ0 153 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 XPNPEP2O43895 674 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 NDUFS2O75306 463 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 NIPSNAP2O75323 286 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SOAT2O75908 522 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 NDST3O95803 873 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CST1P01037 141 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CHRNA1P02708 482 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ACVRL1P37023 503 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 DCTP40126 519 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 IL10RBQ08334 325 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 EPS8Q12929 822 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SERINC3Q13530 473 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 DNASE1L3Q13609 305 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 C10orf111Q8N326 155 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 OR2T12Q8NG77 320 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CD200R1Q8TD46 325 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 FRS2Q8WU20 508 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 TRIB2Q92519 343 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SMIM14Q96QK8 99 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ACTR8Q9H981 624 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.5□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 TTC34A8MYJ7 566 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 OR7A17O14581 309 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SLC22A1O15245 554 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SLC16A6O15403 523 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 OR1I1O60431 355 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PRKD3O94806 890 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CAPN1P07384 714 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CCDC159P0C7I6 412 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PRKACGP22612 351 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PSMA3P25788 255 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PLIN5Q00G26 463 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 OCA2Q04671 838 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CYP4F3Q08477 520 aa6.49□□□□□ -1.37
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