RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BTRCQ9Y297 605 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR4F21O95013 312 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LINC00032P0C843 101 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HSPA7P48741 367 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDKL1Q00532 357 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HSPA14Q0VDF9 509 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHKG1Q16816 387 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AGKQ53H12 422 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NEK10Q6ZWH5 1172 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DSELQ8IZU8 1212 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GLYATL1Q969I3 302 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARRDC3Q96B67 414 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RHBDF1Q96CC6 855 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DTD2Q96FN9 168 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC25A23Q9BV35 468 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CD244Q9BZW8 370 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TUBB1Q9H4B7 451 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ASB1Q9Y576 335 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TIMM22Q9Y584 194 aa17.09■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DENND4AQ7Z401 1863 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FADS2P1A8MWK0 482 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC16A5O15375 505 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HIST1H2ADP20671 130 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCNG1P51959 295 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ACTR3P61158 418 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 E2F5Q15329 346 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GSTA3Q16772 222 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MMEL1Q495T6 779 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GK5Q6ZS86 529 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF765Q7L2R6 523 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPATA19Q7Z5L4 167 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PGAM4Q8N0Y7 254 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ASZ1Q8WWH4 475 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ELMO1Q92556 727 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 COQ10AQ96MF6 247 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HIST1H2AJQ99878 128 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 H2AFJQ9BTM1 129 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ITM2BQ9Y287 266 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 L3MBTL1Q9Y468 752 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHD9Q3L8U1 2897 aa17.08■□□□□ 0.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DOCK8Q8NF50 2099 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A0A1B0GTL3 188 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MTX2O75431 263 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KAT7O95251 611 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PSMG1O95456 288 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADRB3P13945 408 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CYP2A7P20853 494 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RPIAP49247 311 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OGFOD2Q6N063 350 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PGM2L1Q6PCE3 622 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MIER2Q8N344 545 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FBXW8Q8N3Y1 598 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDYL2Q8N8U2 506 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYADMQ96S97 322 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IPPKQ9H8X2 491 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC167Q9P0B6 97 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF225Q9UK10 706 aa17.08■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 K7EPI3 171 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TAPBPO15533 448 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 APODP05090 189 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HGFP14210 728 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IDO1P14902 403 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GRIA2P42262 883 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ERVPABLB-1P60509 514 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC6Q16204 474 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 XKR7Q5GH72 579 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR52B6Q8NGF0 335 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 METTL6Q8TCB7 284 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM129BQ96TA1 746 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GDF15Q99988 308 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KXD1Q9BQD3 176 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMEM79Q9BSE2 394 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC12A9Q9BXP2 914 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PARVBQ9HBI1 364 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARL15Q9NXU5 204 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 H0Y3Z8 333 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATG13O75143 517 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HMOX2P30519 316 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IL12RB1P42701 662 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MTTPP55157 894 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RPS6KA2Q15349 733 aa17.07■□□□□ 0.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms