RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	BBS9	Q3SYG4	887 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	STEAP4	Q687X5	459 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	C8orf74	Q6P047	294 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CES3	Q6UWW8	571 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	XKR5	Q6UX68	686 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	GALNT7	Q86SF2	657 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	PIM3	Q86V86	326 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SEC14L1	Q92503	715 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	GATA6	Q92908	595 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	STRADB	Q9C0K7	418 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	P2RY12	Q9H244	342 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SNX24	Q9Y343	169 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CS	O75390	466 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CTAGE8	P0CG41	777 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CD1C	P29017	333 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	OR1D5	P58170	312 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	RTP5	Q14D33	572 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TMED2	Q15363	201 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	MSS51	Q4VC12	460 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CENPU	Q71F23	418 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	PDZD3	Q86UT5	571 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ELMO1	Q92556	727 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	LPGAT1	Q92604	370 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	NXPE2	Q96DL1	559 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	WWP1	Q9H0M0	922 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	PDP2	Q9P2J9	529 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ACACA	Q13085	2346 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	GPC4	O75487	556 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	S1PR4	O95977	384 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	APOA4	P06727	396 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ELK3	P41970	407 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	PDX1	P52945	283 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	INHBC	P55103	352 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	MAP9	Q49MG5	647 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SYTL3	Q4VX76	610 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL35	Q6PF15	583 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	KCNMB4	Q86W47	210 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CEP112	Q8N8E3	955 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ART4	Q93070	314 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	C12orf66	Q96MD2	445 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	BIRC8	Q96P09	236 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	RAB33B	Q9H082	229 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		14.3	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	14.29	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	FAM149A	A5PLN7	773 aa		14.29	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	14.29	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	UBXN7	O94888	489 aa		14.29	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SLCO2B1	O94956	709 aa		14.29	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SPINK2	P20155	84 aa		14.29	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	AOAH	P28039	575 aa		14.29	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ATP5D	P30049	168 aa		14.29	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	LSS	P48449	732 aa		14.29	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	LIMK2	P53671	638 aa		14.29	□□□□□ -0.12

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