RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4D9Q8NGE8 314 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC39Q96DD0 335 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TSSK1BQ9BXA7 367 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 P2RY12Q9H244 342 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 OR52A5Q9H2C5 316 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 RDH14Q9HBH5 336 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PSMD13Q9UNM6 376 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 UNC13CQ8NB66 2214 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC187A0A096LP49 1063 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC5A10A0PJK1 596 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TP73O15350 636 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 DXOO77932 396 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PGAM1P18669 254 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFS1P28331 727 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 LIMK2P53671 638 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 C2orf54Q08AI8 447 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 LONRF1Q17RB8 773 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP9Q49MG5 647 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CILP2Q8IUL8 1156 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ELMO1Q92556 727 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 C12orf66Q96MD2 445 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 NUDT22Q9BRQ3 303 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 WHRNQ9P202 907 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 SNX24Q9Y343 169 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA8TH3BQL2 631 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 RAD51CO43502 376 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PDHA2P29803 388 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 RPL21P46778 160 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ARL4CP56559 192 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP4F3Q08477 520 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR18Q14330 331 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 MSS51Q4VC12 460 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 SPANXN3Q5MJ09 141 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CENPUQ71F23 418 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CALML6Q8TD86 181 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 RMDN2Q96LZ7 410 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PANX3Q96QZ0 392 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM31Q9BZY9 425 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 SEMA6CQ9H3T2 930 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM8A1Q9UBU6 413 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 GNPTGQ9UJJ9 305 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 AK5Q9Y6K8 562 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 H3BMM5 538 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 KPNA5O15131 536 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 GPC4O75487 556 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 UBXN7O94888 489 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ESR1P03372 595 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 AMD1P17707 334 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CSF2RBP32927 897 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 HIF1AQ16665 826 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 BBS9Q3SYG4 887 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 DUPD1Q68J44 220 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PLXDC1Q8IUK5 500 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 OTUD6BQ8N6M0 293 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ASZ1Q8WWH4 475 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 NCSTNQ92542 709 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 LPGAT1Q92604 370 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF592Q92610 1267 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 BIRC8Q96P09 236 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 CMKLR1Q99788 373 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB33BQ9H082 229 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-204ENST00000442563 OGFRQ9NZT2 677 aa16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms