RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433383.1

NEK4P1-201, Transcript of NIMA-related kinase 4 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEK4P1, Length 879 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P1-201ENST00000433383 TTKP33981 857 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 GP5P40197 560 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 WNT5AP41221 380 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 THOP1P52888 689 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 CDH6P55285 790 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 SELENOVP59797 346 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 PPARDQ03181 441 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 ASPHQ12797 758 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 TROAPQ12815 778 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 GPM6BQ13491 265 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 MAMLD1Q13495 774 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 BFSP2Q13515 415 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 SLC39A14Q15043 492 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 ALX1Q15699 326 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 CHRNA6Q15825 494 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 TTMPQ5BVD1 217 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 LCE3AQ5TA76 89 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 DCAF12L2Q5VW00 463 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 SNX30Q5VWJ9 437 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 PMS2CLQ68D20 193 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 TANGO2Q6ICL3 276 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 TRIM65Q6PJ69 517 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 TMTC3Q6ZXV5 915 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 CYB5R4Q7L1T6 521 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 MIER3Q7Z3K6 550 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 ADGRA1Q86SQ6 560 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 CDH26Q8IXH8 852 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 CCDC112Q8NEF3 446 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 SLC22A8Q8TCC7 542 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 IFT81Q8WYA0 676 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 KAT2AQ92830 837 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 PEX13Q92968 403 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 PHKBQ93100 1093 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 RHBDF1Q96CC6 855 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 EEF2KMTQ96G04 330 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 DACH2Q96NX9 599 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 GPR78Q96P69 363 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 GBP5Q96PP8 586 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 NUF2Q9BZD4 464 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 CARD9Q9H257 536 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 EXO5Q9H790 373 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 LRRC40Q9H9A6 602 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 CERS4Q9HA82 394 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 KRT84Q9NSB2 600 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 KLHL28Q9NXS3 571 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 IL37Q9NZH6 218 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 OGDHLQ9ULD0 1010 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 GAB2Q9UQC2 676 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 KLHL20Q9Y2M5 609 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 TTC41PQ6P2S7 1318 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 TTC21AQ8NDW8 1320 aa3.59□□□□□ -1.83
NEK4P1-201ENST00000433383 UQCRHLA0A096LP55 91 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 A0A0U1RQS6 177 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 MACROD2A1Z1Q3 448 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 TMEM247A6NEH6 219 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 TMEM210A6NLX4 147 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 TAF4O00268 1085 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 SYT5O00445 386 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 ATP2A1O14983 1001 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 CRCPO75575 148 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 RPS6KA5O75582 802 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 FLOT1O75955 427 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 MYO1DO94832 1006 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 RHOBTB1O94844 696 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 SNAPINO95295 136 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 NFATC1O95644 943 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 CLPTM1O96005 669 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 POLBP06746 335 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 UQCRHP07919 91 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 CSH1P0DML2 217 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 CSH2P0DML3 217 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 CCNA2P20248 432 aa3.58□□□□□ -1.84
NEK4P1-201ENST00000433383 TNFSF4P23510 183 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.9 ms