RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428740.5

IMP4-204, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene IMP4, Length 924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-204ENST00000428740 KIF26BQ2KJY2 2108 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 SGTAO43765 313 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 RAD1O60671 282 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 ITGB2P05107 769 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 GFERP55789 205 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 MAP7Q14244 749 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 IRGCQ6NXR0 463 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 OOSP2Q86WS3 158 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 SPRY4Q9C004 299 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 MATN2O00339 956 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 CEP104O60308 925 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 FGGP02679 453 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 FTH1P02794 183 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 APRTP07741 180 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 SFTPCP11686 197 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 ARL4DP49703 201 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 ARSDP51689 593 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 CCZ1BP86790 482 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 FOXM1Q08050 763 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 PRKAA1Q13131 559 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 PACS1Q6VY07 963 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 ESX1Q8N693 406 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 TTC9Q92623 222 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 RSC1A1Q92681 617 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 SGSM3Q96HU1 749 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 TLR10Q9BXR5 811 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 PDE7BQ9NP56 450 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 CASS4Q9NQ75 786 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 OR5K3A6NET4 321 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 CCL22O00626 93 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 MAP3K7O43318 606 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 STK17BO94768 372 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 MT-ND3P03897 115 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 OR56A5P0C7T3 313 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 NPY2RP49146 381 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 SEPHS1P49903 392 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 CDK16Q00536 496 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 ACY1Q03154 408 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 ABHD18Q0P651 414 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 DBN1Q16643 649 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 PCID2Q5JVF3 399 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 GPR150Q8NGU9 434 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 HDAC10Q969S8 669 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 OR6C1Q96RD1 312 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 CTRCQ99895 268 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 COG4Q9H9E3 785 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 CACNA1GO43497 2377 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 SCN8AQ9UQD0 1980 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.63□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 KDM1AO60341 852 aa14.63□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 FGF5P12034 268 aa14.63□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 ETS1P14921 441 aa14.63□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 PRAMEP78395 509 aa14.63□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 HSD11B2P80365 405 aa14.63□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IMP4-204ENST00000428740 MC1RQ01726 317 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms