RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 D2HGDHQ8N465 521 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 C12orf66Q96MD2 445 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 MAP3K3Q99759 626 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 WWP1Q9H0M0 922 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 LHX9Q9NQ69 397 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.48■□□□□ 0.87
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LIMS1-208ENST00000428064 HSD11B2P80365 405 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa20.48■□□□□ 0.87
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LIMS1-208ENST00000428064 ABHD17AQ96GS6 310 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.48■□□□□ 0.87
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LIMS1-208ENST00000428064 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.48■□□□□ 0.87
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LIMS1-208ENST00000428064 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa20.47■□□□□ 0.87
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LIMS1-208ENST00000428064 OLIG2Q13516 323 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 DNASE1L3Q13609 305 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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LIMS1-208ENST00000428064 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.47■□□□□ 0.87
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LIMS1-208ENST00000428064 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa20.46■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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LIMS1-208ENST00000428064 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.46■□□□□ 0.87
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LIMS1-208ENST00000428064 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.46■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 COPS8Q99627 209 aa20.46■□□□□ 0.87
LIMS1-208ENST00000428064 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.46■□□□□ 0.87
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LIMS1-208ENST00000428064 LATS2Q9NRM7 1088 aa20.46■□□□□ 0.87
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LIMS1-208ENST00000428064 FURINP09958 794 aa20.45■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 KCTD11Q693B1 232 aa20.45■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa20.44■□□□□ 0.86
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LIMS1-208ENST00000428064 KATNA1O75449 491 aa20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 GSTM1P09488 218 aa20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 MSL3P1P0C860 447 aa20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF75DP51815 510 aa20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 VAV2P52735 878 aa20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 PMS2P54278 862 aa20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 GSTM4Q03013 218 aa20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-208ENST00000428064 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.44■□□□□ 0.86
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