RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRSK1Q8TDC3 778 aa16.08■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FATE1Q969F0 183 aa16.08■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NACC2Q96BF6 587 aa16.08■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EID2BQ96D98 161 aa16.08■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AGAP4Q96P64 663 aa16.08■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS35Q96QK1 796 aa16.08■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMD13Q9UNM6 376 aa16.08■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EPHB6O15197 1021 aa16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DIAPH2O60879 1101 aa16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLK7P49862 253 aa16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDH24Q86UP0 819 aa16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2Y1Q8NGV0 311 aa16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GDAP1Q8TB36 358 aa16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTERQ96BW5 349 aa16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDOR1Q9UHB4 597 aa16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCA2Q9BZC7 2435 aa16.07■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AGPSO00116 658 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF749O43361 778 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TPM2P07951 284 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC172P0C7W6 258 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD1EP15812 388 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCNCP24863 283 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NIPAL4Q0D2K0 466 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASIC2Q16515 512 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMTNL2Q2TAL5 461 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FKBP15Q5T1M5 1219 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR135Q8IZ08 494 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPH1Q92598 858 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC120Q96HB5 630 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNDP1Q96KN2 507 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAGEE1Q9HCI5 957 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC24A2Q9UI40 661 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POMT2Q9UKY4 750 aa16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PKDREJQ9NTG1 2253 aa16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNN4O15554 427 aa16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POP7O75817 140 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GALNT2Q10471 571 aa16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GALNT3Q14435 633 aa16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAMK4Q16566 473 aa16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XKRXQ6PP77 449 aa16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF653Q96CK0 615 aa16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPM1MQ96MI6 270 aa16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR63Q9BZJ6 419 aa16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHOC2Q9UQ13 582 aa16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa16.05■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZGRF1Q86YA3 2104 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC66A2RUB6 948 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDH17O14917 1159 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HLA-DQB2P05538 268 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HLA-DPA1P20036 260 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL1R2P27930 398 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFS1P28331 727 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD86P42081 329 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC122Q5T0U0 273 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PROKR1Q8TCW9 393 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C14orf79Q96F83 325 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSGA13Q96PP4 275 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AP1M1Q9BXS5 423 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM7Q9C029 511 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF711Q9Y462 761 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCINQ9Y6U3 715 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SVILO95425 2214 aa16.04■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.03■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP16.03■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa16.03■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCL21O00585 134 aa16.03■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC4A1P02730 911 aa16.03■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RARAP10276 462 aa16.03■□□□□ 0.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNK10P57789 538 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms