RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 OARD1Q9Y530 152 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CEPT1Q9Y6K0 416 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ETS2P15036 469 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 PCSK2P16519 638 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 JAK1P23458 1154 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TWF1Q12792 350 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 MERTKQ12866 999 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 GTF2H2Q13888 395 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TAF12Q16514 161 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 SLC36A3Q495N2 470 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 LETMD1Q6P1Q0 360 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TTC23LQ6PF05 361 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CHRDL2Q6WN34 429 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 SNX20Q7Z614 316 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 MYO19Q96H55 970 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 IGSF21Q96ID5 467 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ACOX2Q99424 681 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 KLHL42Q9P2K6 505 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 MAFFQ9ULX9 164 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 YIPF1Q9Y548 306 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ACOX3O15254 700 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TBL1XO60907 577 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 DGKAP23743 735 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 IL12AP29459 219 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 SFRP1Q8N474 314 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 FIBCD1Q8N539 461 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 OR52B6Q8NGF0 335 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 UBTD2Q8WUN7 234 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 MPP4Q96JB8 637 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ADI1Q9BV57 179 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 LATS2Q9NRM7 1088 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 VPS51Q9UID3 782 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 AP3M1Q9Y2T2 418 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 AK5Q9Y6K8 562 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 A0A087WXM4 84 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 OR7A17O14581 309 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 LSM1O15116 133 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 INPP4BO15327 924 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 FFAR2O15552 330 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 SOCS5O75159 536 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TULP3O75386 442 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 WDR47O94967 919 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CAPN1P07384 714 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 GPR33Q49SQ1 333 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 RABL3Q5HYI8 236 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 RETSATQ6NUM9 610 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 LINGO4Q6UY18 593 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 OR8J3Q8NGG0 315 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ASB1Q9Y576 335 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 SAC3D1A6NKF1 404 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD28O15084 1053 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 FBXO48Q5FWF7 155 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CDKL4Q5MAI5 379 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 DLEU7Q6UYE1 221 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 SERPINA9Q86WD7 417 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 WBP2Q969T9 261 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ACDQ96AP0 544 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 EID2BQ96D98 161 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 CAAP1Q9H8G2 361 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 RDH14Q9HBH5 336 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 ASIC5Q9NY37 505 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 REV3LO60673 3130 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-205ENST00000409985 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 C2orf78A6NCI8 922 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 C9JVG2 144 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 LDLRP01130 860 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 SOD2P04179 222 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 IRF1P10914 325 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 RPL17P18621 184 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 ITGALP20701 1170 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 OXTRP30559 389 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CDK9P50750 372 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 PWP1Q13610 501 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 TIGD2Q4W5G0 525 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 IL27RAQ6UWB1 636 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 MACC1Q6ZN28 852 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 Q6ZNB5 142 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 TDHQ8IZJ6 230 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 FAM47BQ8NA70 645 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 OR4F6Q8NGB9 312 aa23.39■■□□□ 1.33
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