RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKS6Q68DC2 871 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 PRELID2Q8N945 189 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 PEX13Q92968 403 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 C12orf66Q96MD2 445 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 TGM7Q96PF1 710 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CCM2Q9BSQ5 444 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 VPS37BQ9H9H4 285 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 OR51F1A6NGY5 319 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 AP2A2O94973 939 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 POLBP06746 335 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 NSG1P42857 185 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 KLHL35Q6PF15 583 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 HDAC10Q969S8 669 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF778Q96MU6 729 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 COG4Q9H9E3 785 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR70Q9NW82 654 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 GSTM1P09488 218 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 GSTM4Q03013 218 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CEACAM20Q6UY09 585 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 PACS1Q6VY07 963 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 PRSS42Q7Z5A4 293 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SGSM3Q96HU1 749 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 PBKQ96KB5 322 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ZPBPQ9BS86 351 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SPRY4Q9C004 299 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 OR52A5Q9H2C5 316 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 APMAPQ9HDC9 416 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 QSOX1O00391 747 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 RHDQ02161 417 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 RPA4Q13156 261 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 GSE1Q14687 1217 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 PLCL1Q15111 1095 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 MANEAQ5SRI9 462 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 IRGCQ6NXR0 463 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 KLHL6Q8WZ60 621 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 NKD1Q969G9 470 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CTRCQ99895 268 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SEMA5BQ9P283 1151 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 AP3B1O00203 1094 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSCAN12O43309 604 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 RASSF9O75901 435 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 NDUFS1P28331 727 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CD151P48509 253 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SEPHS1P49903 392 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK16Q00536 496 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 PCID2Q5JVF3 399 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF534Q76KX8 674 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 OR4L1Q8NH43 312 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 PILRAQ9UKJ1 303 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ATRXP46100 2492 aa20.08■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 OR5K3A6NET4 321 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 ERVH48-1M5A8F1 160 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TPSB2P20231 275 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 PDHA2P29803 388 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 NPY2RP49146 381 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP1A2P50993 1020 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1CAP62136 330 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TPSAB1Q15661 275 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 PCSK4Q6UW60 755 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 VASH2Q86V25 355 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms