RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 FMO4P31512 558 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CCKBRP32239 447 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 NSG1P42857 185 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PAFAH1B1P43034 410 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LSSP48449 732 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PGGT1BP53609 377 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LIMK2P53671 638 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GFERP55789 205 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PRAMEP78395 509 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MPP1Q00013 466 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SLC7A5Q01650 507 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DR1Q01658 176 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CTBP1Q13363 440 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GTF2H3Q13889 308 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SPIDRQ14159 915 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GPR18Q14330 331 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GRB7Q14451 532 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GBX1Q14549 363 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KIR2DS5Q14953 304 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MORF4L2Q15014 288 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 BRD3Q15059 726 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PPP1R7Q15435 360 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 STEAP4Q687X5 459 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DUPD1Q68J44 220 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 NEPROQ6NW34 567 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM71Q6P5X7 295 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ZDHHC24Q6UX98 284 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CERS6Q6ZMG9 384 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 NLRP9Q7RTR0 991 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SLC9B2Q86UD5 537 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 HOOK3Q86VS8 718 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PROSER1Q86XN7 944 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CILP2Q8IUL8 1156 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PPIL6Q8IXY8 311 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 BMPERQ8N8U9 685 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LRRN4CLQ8ND94 238 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 RCBTB1Q8NDN9 531 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PHC3Q8NDX5 983 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GIMAP7Q8NHV1 300 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 HM13Q8TCT9 377 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 NCSTNQ92542 709 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LPGAT1Q92604 370 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 RSC1A1Q92681 617 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LRRC45Q96CN5 670 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DCUN1D1Q96GG9 259 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC74BQ96LY2 380 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 C12orf66Q96MD2 445 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PPM1MQ96MI6 270 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DEPDC7Q96QD5 511 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SLC38A3Q99624 504 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ERP44Q9BS26 406 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LRRC1Q9BTT6 524 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MENTQ9BUN1 341 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TRIM31Q9BZY9 425 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 NRSN2Q9GZP1 204 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ABCG4Q9H172 646 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DPH5Q9H2P9 285 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 UCK1Q9HA47 277 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 EPB41L5Q9HCM4 733 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SLC40A1Q9NP59 571 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ASCL3Q9NQ33 180 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SMYD2Q9NRG4 433 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 EVA1BQ9NVM1 165 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 OCIAD1Q9NX40 245 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KCNK4Q9NYG8 393 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DKK4Q9UBT3 224 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CDC23Q9UJX2 597 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SATB2Q9UPW6 733 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MRFAP1Q9Y605 127 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TEX264Q9Y6I9 313 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 FAM169AQ9Y6X4 670 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CACNA1BQ00975 2339 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 EPG5Q9HCE0 2579 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms