RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389589.8

SHOX2-201, Transcript of short stature homeobox 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHOX2, Length 2,072 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOX2-201ENST00000389589 FTH1P02794 183 aa24.75■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 MTTPP55157 894 aa24.75■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 GRIN2CQ14957 1233 aa24.75■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 XKR7Q5GH72 579 aa24.75■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 TTC23LQ6PF05 361 aa24.75■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa24.75■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 SPATA19Q7Z5L4 167 aa24.75■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 DLG3Q92796 817 aa24.75■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 SLC25A23Q9BV35 468 aa24.75■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 SUN2Q9UH99 717 aa24.75■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 MYO9BQ13459 2157 aa24.75■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 TBC1D3BA6NDS4 549 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 OPRD1P41143 372 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 HSPA7P48741 367 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 ERVPABLB-1P60509 514 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 HYAL1Q12794 435 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 GSTA3Q16772 222 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 FAM219BQ5XKK7 198 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 FBXL19Q6PCT2 694 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 CYP2U1Q7Z449 544 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 OR52B6Q8NGF0 335 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 ATP6V1E2Q96A05 226 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 AP2M1Q96CW1 435 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 TRIM54Q9BYV2 358 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 EBF2Q9HAK2 575 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 RIC8BQ9NVN3 520 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 CCDC167Q9P0B6 97 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 OPTCQ9UBM4 332 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 FADS2P1A8MWK0 482 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 ANXA5P08758 320 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 PRR35P0CG20 571 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 CDKL1Q00532 357 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 HSPA14Q0VDF9 509 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 RCN1Q15293 331 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 NEK10Q6ZWH5 1172 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 GLYATL1Q969I3 302 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 ARRDC3Q96B67 414 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 COQ10AQ96MF6 247 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 IPPKQ9H8X2 491 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 CEP290O15078 2479 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 OR7A17O14581 309 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 SLC16A5O15375 505 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 KRT36O76013 467 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 ANP32DO95626 131 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 HGFP14210 728 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 GPX3P22352 226 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 GJA4P35212 333 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 SP140Q13342 867 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 GRB7Q14451 532 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 KIF19Q2TAC6 998 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 DSG4Q86SJ6 1040 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 MIER2Q8N344 545 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 CDYL2Q8N8U2 506 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 SUSD6Q92537 303 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 FAM129BQ96TA1 746 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 TMEM79Q9BSE2 394 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 SLC12A9Q9BXP2 914 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 WDR41Q9HAD4 459 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 ST14Q9Y5Y6 855 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 RFXAPO00287 272 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 LINC01565O15544 149 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 PDE5AO76074 875 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 IDO1P14902 403 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 GNAZP19086 355 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 PIK3CGP48736 1102 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 RPIAP49247 311 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 CCNG1P51959 295 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 CCDC6Q16204 474 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 MMEL1Q495T6 779 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 ATAT1Q5SQI0 421 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 LETMD1Q6P1Q0 360 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 TCAIMQ8N3R3 496 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 METTL6Q8TCB7 284 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 DTD2Q96FN9 168 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 PARVBQ9HBI1 364 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 STOML1Q9UBI4 398 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 K7EPI3 171 aa24.72■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 MTX2O75431 263 aa24.72■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 PSMC3P17980 439 aa24.72■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 WLSQ5T9L3 541 aa24.72■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 ASZ1Q8WWH4 475 aa24.72■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 ASB11Q8WXH4 323 aa24.72■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 NPAS2Q99743 824 aa24.72■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 DYRK4Q9NR20 520 aa24.72■■□□□ 1.55
SHOX2-201ENST00000389589 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms