RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377689.2

FAM220BP-201, Transcript of family with sequence similarity 220 member B, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene FAM220BP, Length 816 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BP-201ENST00000377689 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 PRDM8Q9NQV8 689 aa16■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 SIRPGQ9P1W8 387 aa16■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 KLHL42Q9P2K6 505 aa16■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 DCDC2BA2VCK2 349 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 FAM159BA6NKW6 160 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 PDZK1P1A8MUH7 402 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 HAUS5O94927 633 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 C1QAP02745 245 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 AHSGP02765 367 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 AOAHP28039 575 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 FMO4P31512 558 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 CD151P48509 253 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 MPP1Q00013 466 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 NR1D2Q14995 579 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 ZNF438Q7Z4V0 828 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 SLC9B2Q86UD5 537 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 ASZ1Q8WWH4 475 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 PATE1Q8WXA2 126 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 KCNJ9Q92806 393 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 FUT8Q9BYC5 575 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 OR52A5Q9H2C5 316 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 CCDC68Q9H2F9 335 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 GPC4O75487 556 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 TRIM16O95361 564 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 APOA4P06727 396 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 CD9P21926 228 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 GABRB3P28472 473 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 CCR7P32248 378 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 PHBP35232 272 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 MAZP56270 477 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 DNAJC3Q13217 504 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 NAB1Q13506 487 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 TMED2Q15363 201 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 KYNUQ16719 465 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 GUSBP11Q6P575 273 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 CNSTQ6PJW8 725 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 SFTPA2Q8IWL1 248 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 IFI44Q8TCB0 444 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 UBXN4Q92575 508 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 TMEM159Q96B96 161 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 SH3KBP1Q96B97 665 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 UCK1Q9HA47 277 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 POT1Q9NUX5 634 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 WDR70Q9NW82 654 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 NINJ2Q9NZG7 142 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 CPNE7Q9UBL6 633 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 WDR37Q9Y2I8 494 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 DCHS1Q96JQ0 3298 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 IQCF5A8MTL0 148 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 GIPC1O14908 333 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 ZW10O43264 779 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 NIPSNAP2O75323 286 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 RFPL3O75679 317 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 SLCO2B1O94956 709 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 FTH1P19P0C7X4 201 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 SLC19A1P41440 591 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 GPR3P46089 330 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 E2F1Q01094 437 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 HHEXQ03014 270 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 GBX1Q14549 363 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 CLCA4Q14CN2 919 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 SYTL3Q4VX76 610 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 OTOAQ7RTW8 1153 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 PDZD3Q86UT5 571 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 KRT222Q8N1A0 295 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 WDR48Q8TAF3 677 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 FBF1Q8TES7 1133 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 ZFPM2Q8WW38 1151 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 RMDN2Q96LZ7 410 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 CPNE1Q99829 537 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM220BP-201ENST00000377689 MCMBPQ9BTE3 642 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms