RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C1RP00736 705 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYBBP04839 570 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RHOCP08134 193 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HOXA9P31269 272 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACVRL1P37023 503 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NRG3P56975 720 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LIPIQ6XZB0 460 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUP43Q8NFH3 380 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR7D4Q8NG98 312 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FGF13Q92913 245 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRC45Q96CN5 670 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HMCESQ96FZ2 354 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNF8Q96H20 258 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PWWP2AQ96N64 755 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HMX2A2RU54 273 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 J3KR12 359 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MOSPD3O75425 235 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TPPPO94811 219 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SCGB1D1O95968 90 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGLV3-27P01718 113 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 APRTP07741 180 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRKCAP17252 672 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HCAR3P49019 387 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CD83Q01151 205 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TFF2Q03403 129 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM153CQ494X1 144 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GALNTL6Q49A17 601 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DENND2CQ68D51 928 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MFN1Q8IWA4 741 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LEMD2Q8NC56 503 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPSB4Q96A44 273 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FMO2Q99518 471 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BBS2Q9BXC9 721 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLDN11O75508 207 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLEC3BP05452 202 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CEACAM5P06731 702 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LAMP2P13473 410 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCNB1P14635 433 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNA5P22460 613 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GLDCP23378 1020 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSMA3P25788 255 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAXP61244 160 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC7A9P82251 487 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTK6Q13882 451 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DUPD1Q68J44 220 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BICRALQ6AI39 1079 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINGO4Q6UY18 593 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM25Q86YD3 366 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 YAF2Q8IY57 180 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PERPQ96FX8 193 aa6.36□□□□□ -1.39
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