RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 METTL18O95568 372 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CCL14Q16627 93 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 RIIAD1A6NNX1 92 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 PIP5K1BO14986 540 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 GPD2P43304 727 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 DPYSQ14117 519 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CRY2Q49AN0 593 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 AAGABQ6PD74 315 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ING4Q9UNL4 249 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF33A8MVX0 844 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 IFNA6P05013 189 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 DBIP07108 87 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 L1CAMP32004 1257 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TIE1P35590 1138 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SMCO1Q147U7 214 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 LPGAT1Q92604 370 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 KCNS3Q9BQ31 491 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TAPBPLQ9BX59 468 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TCF4P15884 667 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 LIMK2P53671 638 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF781Q8N8C0 355 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CHST4Q8NCG5 386 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 COPS7AQ9UBW8 275 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TESMINQ9Y4I5 508 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PRU2 124 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SNHG28P0DPA3 235 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 DAOAP59103 153 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 IFNW1P05000 195 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 GNALP38405 381 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CDH12P55289 794 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 JAM2P57087 298 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 LCP2Q13094 533 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 GHDCQ8N2G8 530 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 PRKCHP24723 683 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 S100ZQ8WXG8 99 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 GSC2O15499 205 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 IL10RBQ08334 325 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 C2orf27AQ580R0 203 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CAPN8A6NHC0 703 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 YJEFN3A6XGL0 299 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 HOXC12P31275 282 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 AP1S1P61966 158 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SMU1Q2TAY7 513 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 HGSNATQ68CP4 663 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 OR2L5Q8NG80 312 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0G2JN53 185 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 B3GALT2O43825 422 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 AHCYP23526 432 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 HTR7P34969 479 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 AVPR1BP47901 424 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CA9Q16790 459 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 DLK2Q6UY11 383 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 FATE1Q969F0 183 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ASPAP45381 313 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC28BQ9BUN5 200 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 PHF24Q9UPV7 400 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TBX18O95935 607 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CHRNA4P43681 627 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TM7SF2O76062 418 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGDIBP52566 201 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 GDF10P55107 478 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CLIP4Q8N3C7 705 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 OR10A6Q8NH74 314 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHA1Q9HB21 404 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 AK5Q9Y6K8 562 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 FRMD6Q96NE9 622 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 SYT17Q9BSW7 474 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ERVK-11Q9UQG0 969 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CHST10O43529 356 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 GALNT7Q86SF2 657 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 MCFD2Q8NI22 146 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PIGXQ8TBF5 258 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ARMC5Q96C12 935 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 C2CD4BA6NLJ0 364 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ARSIQ5FYB1 569 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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