RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 MFSD14CQ5VZR4 134 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TTI2Q6NXR4 508 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 USP53Q70EK8 1073 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ITIH5Q86UX2 942 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CLYBLQ8N0X4 340 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 BVESQ8NE79 360 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CD101Q93033 1021 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RAB24Q969Q5 203 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SNX22Q96L94 193 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 C5orf34Q96MH7 638 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PANX1Q96RD7 426 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MIS12Q9H081 205 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SRRDQ9UH36 339 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 HAO1Q9UJM8 370 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PADI1Q9ULC6 663 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 HPSEQ9Y251 543 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 VWA7Q9Y334 891 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 AOX1Q06278 1338 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZNF98A6NK75 572 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 A8MXQ7 604 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 E5RI56 91 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CES2O00748 559 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ITGB1BP1O14713 200 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 HS3ST1O14792 307 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MDM4O15151 490 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CDH16O75309 829 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SNAP29O95721 258 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CALB1P05937 261 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 HMBSP08397 361 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CCL2P13500 99 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 GFAPP14136 432 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RPA2P15927 270 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PIK3R1P27986 724 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 P2RY4P51582 365 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PLK1P53350 603 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CEBPGP53567 150 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RAD23BP54727 409 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 UBE2G2P60604 165 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TNNC1P63316 161 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 VEZF1Q14119 521 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CCNJQ5T5M9 372 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ARSKQ6UWY0 536 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 WDR48Q8TAF3 677 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 P3H4Q92791 437 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PRRC1Q96M27 445 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PCYT2Q99447 389 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SLC32A1Q9H598 525 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PNPOQ9NVS9 261 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RMND1Q9NWS8 449 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms