RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302313.9

WDR48-201, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene WDR48, Length 3,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-201ENST00000302313 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa7.1□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 C11orf49Q9H6J7 331 aa7.1□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.1□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TREX1Q9NSU2 369 aa7.1□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TRPV2Q9Y5S1 764 aa7.1□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 GREB1Q4ZG55 1949 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SAGE2PA6NJ88 616 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 F5H423 210 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 H0YAE9 185 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CD4P01730 458 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 RPS17P08708 135 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 STMN1P16949 149 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ATF6P18850 670 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CYP2A7P20853 494 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ATP6V1B2P21281 511 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 GPX3P22352 226 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PRIM2P49643 509 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 DESI1Q6ICB0 168 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ZNF544Q6NX49 715 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 NOTUMQ6P988 496 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 FUNDC1Q8IVP5 155 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CCNYQ8ND76 341 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TSPEARQ8WU66 669 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SEPT8Q92599 483 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MARK4Q96L34 752 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MYRFLQ96LU7 910 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 HTATIP2Q9BUP3 242 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ACTR3BQ9P1U1 418 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TMEM233B4DJY2 109 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 H0Y626 953 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 H3BMM5 538 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MRASO14807 208 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 NDUFS2O75306 463 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MATN4O95460 622 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 NFKB1P19838 968 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SERPINB1P30740 379 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ADRA1AP35348 466 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 IGSF11Q5DX21 431 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 GPAT4Q86UL3 456 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 NPWQ8N729 165 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 RNF34Q969K3 372 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MAGED4Q96JG8 741 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 FCRL5Q96RD9 977 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 WACQ9BTA9 647 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PIGVQ9NUD9 493 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ENOPH1Q9UHY7 261 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.09□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 I6L893 689 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 KCNK1O00180 336 aa7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 ARVCFO00192 962 aa7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 USP12O75317 370 aa7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 KCNH1O95259 989 aa7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 GPIP06744 558 aa7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 FCGR1AP12314 374 aa7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 IL12AP29459 219 aa7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 SLC22A9Q8IVM8 553 aa7.09□□□□□ -1.28
WDR48-201ENST00000302313 BEST2Q8NFU1 509 aa7.09□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms