RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 EID3Q8N140 333 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX26Q8N6G2 289 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TLR10Q9BXR5 811 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR63Q9BZJ6 419 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ACSL5Q9ULC5 683 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SCINQ9Y6U3 715 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 LRBAP50851 2863 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MED13LQ71F56 2210 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC66A2RUB6 948 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6C74A6NCV1 312 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 E2F3O00716 465 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF749O43361 778 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 DIAPH2O60879 1101 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX11BO96011 259 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 DRD2P14416 443 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 BRAFP15056 766 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRNB2P17787 502 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MX2P20592 715 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MIPP30301 263 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PCK1P35558 622 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 DMPKQ09013 629 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT81Q14533 505 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 RPE65Q16518 533 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 DPYSL2Q16555 572 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CA9Q16790 459 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PTCHD3Q3KNS1 767 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 LDLRAP1Q5SW96 308 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 NEK11Q8NG66 645 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS35Q96QK1 796 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 AGPAT1Q99943 283 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 IRAK4Q9NWZ3 460 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC23A2Q9UGH3 650 aa7.65□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SVILO95425 2214 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0U1RQS6 177 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 MATN3O15232 486 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 POP7O75817 140 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 CD99P14209 185 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 AMPD1P23109 780 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 IL4RP24394 825 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNCP24863 283 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1CAP62136 330 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP2R2AP63151 447 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 ARG2P78540 354 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRRQ15256 657 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 TESK1Q15569 626 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 HIF1AQ16665 826 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 QPCTQ16769 361 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 MIIPQ5JXC2 388 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 IGFL2Q6UWQ7 119 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 NR4A3Q92570 626 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPH1Q92598 858 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 DLG3Q92796 817 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 INPP5DQ92835 1189 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 FATE1Q969F0 183 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM11Q96F44 468 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC120Q96HB5 630 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf66Q96MD2 445 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 LMF1Q96S06 567 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR24Q96S15 920 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB18PQ96TA0 734 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 NDC1Q9BTX1 674 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.64□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 LHPPQ9H008 270 aa7.64□□□□□ -1.19
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