RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288462.4

C9orf43-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 43, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf43, Length 2,130 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43-201ENST00000288462 SP140Q13342 867 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 RUNX3Q13761 415 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 GRB7Q14451 532 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 E2F5Q15329 346 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 C1orf146Q5VVC0 180 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 NEK10Q6ZWH5 1172 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 DET1Q7L5Y6 550 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 FBXW8Q8N3Y1 598 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 BTN2A2Q8WVV5 523 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 CHFRQ96EP1 664 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 DTD2Q96FN9 168 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 CCT7Q99832 543 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 EFCAB1Q9HAE3 211 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 TIMM22Q9Y584 194 aa10□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 CKAP5Q14008 2032 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 RFXAPO00287 272 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 QSOX1O00391 747 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 KPNA5O15131 536 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 MTX2O75431 263 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 PDE5AO76074 875 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 GUCA1CO95843 209 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 OTCP00480 354 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 FTH1P02794 183 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 C8GP07360 202 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 LINC00032P0C843 101 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 GJA4P35212 333 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 HSPA7P48741 367 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 STX1BP61266 288 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 ELP6Q0PNE2 266 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 RCN1Q15293 331 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 AGKQ53H12 422 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 WLSQ5T9L3 541 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 TTC23LQ6PF05 361 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 STMN2Q93045 179 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 GLYATL1Q969I3 302 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 MYADMQ96S97 322 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 FAM129BQ96TA1 746 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 EGFL8Q99944 293 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 CD244Q9BZW8 370 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 PFDN4Q9NQP4 134 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 WWOXQ9NZC7 414 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 HCN2Q9UL51 889 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 REV3LO60673 3130 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 H0Y3Z8 333 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 K7EPI3 171 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 FBP2O00757 339 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 WNT9AO14904 365 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 SLC16A5O15375 505 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 MATN4O95460 622 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 MSH3P20585 1137 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 CCNG1P51959 295 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 CREB5Q02930 508 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 STX5Q13190 355 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 GRM2Q14416 872 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 ACOX1Q15067 660 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 GSTA3Q16772 222 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 REP15Q6BDI9 236 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 SPATA19Q7Z5L4 167 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 VRK3Q8IV63 474 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 OR2T11Q8NH01 316 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 UCMAQ8WVF2 138 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 ASB11Q8WXH4 323 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 AP2M1Q96CW1 435 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 PPP1R16AQ96I34 528 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 GDF15Q99988 308 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 IPPKQ9H8X2 491 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 WDR41Q9HAD4 459 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 OPTCQ9UBM4 332 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 PDE10AQ9Y233 779 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 POMPQ9Y244 141 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 LAMA3Q16787 3333 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 CDH23Q9H251 3354 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 GFYI3L273 518 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 SLCO2B1O94956 709 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 SOD1P00441 154 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 CAPN1P07384 714 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 ANXA5P08758 320 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf43-201ENST00000288462 ADRB3P13945 408 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms