RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 GIPC1O14908 333 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 EPHX1P07099 455 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 PAMP19021 973 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 TYK2P29597 1187 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 WASP42768 502 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 ENPP2Q13822 863 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 C16orf89Q6UX73 402 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 ZBTB46Q86UZ6 589 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 CHPFQ8IZ52 775 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 AGAP2Q99490 1192 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 SARDHQ9UL12 918 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 SRFP11831 508 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 GRK2P25098 689 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 TIE1P35590 1138 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 HNF1BP35680 557 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 ACVR1Q04771 509 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 C6orf183Q5T699 404 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 CARM1Q86X55 608 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 SNX32Q86XE0 403 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 KYQ8NBH2 561 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D15Q8TC07 691 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 HACD3Q9P035 362 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 SHISA7A6NL88 538 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 J3QRK9 145 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 CHPT1Q8WUD6 406 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 STYXQ8WUJ0 223 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 OR8D1Q8WZ84 308 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 PEX13Q92968 403 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 FBXL8Q96CD0 374 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 EID2BQ96D98 161 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN11A1L157 253 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 BMP10O95393 424 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 METAP1P53582 386 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 SEMG2Q02383 582 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 CEACAM7Q14002 265 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 ZBED5Q49AG3 693 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 PIGGQ5H8A4 983 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 AGR3Q8TD06 166 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 FAM129BQ96TA1 746 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 COG4Q9H9E3 785 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 CROTQ9UKG9 612 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-201ENST00000265339 CKAP5Q14008 2032 aa20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PPW3 197 aa20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 C2orf81A6NN90 581 aa20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFB5O43674 189 aa20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CDKN3Q16667 212 aa20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 HDAC10Q969S8 669 aa20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF597Q96LX8 424 aa20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 TBATAQ96M53 351 aa20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 LYSMD1Q96S90 227 aa20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.02■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PQ67 120 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 A8MX80 341 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 PLOD2O00469 737 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 PRNPP04156 253 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CAPNS1P04632 268 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 NAB1Q13506 487 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CYP2A13Q16696 494 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 IL23RQ5VWK5 629 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 DLG3Q92796 817 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 SCRN2Q96FV2 425 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.4 ms