RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SLC28A1O00337 649 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PAGE1O75459 146 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ALDH3B2P48448 385 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 HSPA7P48741 367 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 OAZ1P54368 228 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CYS1Q717R9 158 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 NELL1Q92832 810 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 MYRFLQ96LU7 910 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 MED28Q9H204 178 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.89□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 A6NL46 340 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 C7P10643 843 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CYP2B6P20813 491 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TTPAP49638 278 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CD47Q08722 323 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SNAPC1Q16533 368 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 BICRALQ6AI39 1079 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CEP97Q8IW35 865 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 OR13J1Q8NGT2 312 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 Q96MT0 163 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TINF2Q9BSI4 451 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PIGVQ9NUD9 493 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TAS2R9Q9NYW1 312 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 POMCP01189 267 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PIGRP01833 764 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PGRP06401 933 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 KIR3DL1P43629 444 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ALDH9A1P49189 494 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 RHOAP61586 193 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CSNK2BP67870 215 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 MZT2AQ6P582 158 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PHC2Q8IXK0 858 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SIAEQ9HAT2 523 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 VPS28Q9UK41 221 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 RHOCP08134 193 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ANXA5P08758 320 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 OR1G1P47890 313 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ATP12AP54707 1039 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 OR4D2P58180 307 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 FOXM1Q08050 763 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 APOFQ13790 326 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 KRT33BQ14525 404 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 KCNC2Q96PR1 638 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 IFT52Q9Y366 437 aa14.88□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SLC1A7O00341 560 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 RCVRNP35243 200 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 LIX1Q8N485 282 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 RAB23Q9ULC3 237 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 GOT2P00505 430 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SLC11A2P49281 568 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ACLYP53396 1101 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CDH12P55289 794 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 HMGCS1Q01581 520 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SPCS2Q15005 226 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.036e-7■■■■□ 20
CASC3-201ENST00000264645 DOK6Q6PKX4 331 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 NDNFQ8TB73 568 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 POF1BQ8WVV4 589 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.87□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PIM2Q9P1W9 311 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms