RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257552.6

MSI1-201, Transcript of musashi RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI1, Length 2,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1-201ENST00000257552 TULP3O75386 442 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 GABARAPL2P60520 117 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CDK5R2Q13319 367 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 NDUFA5Q16718 116 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CCDC103Q8IW40 242 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 MCFD2Q8NI22 146 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TBATAQ96M53 351 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TSGA13Q96PP4 275 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ARL5CA6NH57 179 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 B3GAT3O94766 335 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 THP07101 528 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PPP5CP53041 499 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PPP2R2BQ00005 443 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 LCP2Q13094 533 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SLC14A2Q15849 920 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 USP43Q70EL4 1123 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TAC4Q86UU9 113 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PCED1BQ96HM7 432 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CDK15Q96Q40 435 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 NEK6Q9HC98 313 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 IL37Q9NZH6 218 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 MPP6Q9NZW5 540 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 FAM50BQ9Y247 325 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 MATN3O15232 486 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PRSS23O95084 383 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PNPLA4P41247 253 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 BRCC3P46736 316 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TRPC1P48995 793 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 AIF1P55008 147 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PRKCZQ05513 592 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 STEAP3Q658P3 488 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 OR10A6Q8NH74 314 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SMOQ99835 787 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 BTBD2Q9BX70 525 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ACTR8Q9H981 624 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 NT5MQ9NPB1 228 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 RNF112Q9ULX5 631 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ILVBLA1L0T0 632 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 BCKDKO14874 412 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 RAD51BO15315 384 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PRKD3O94806 890 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PRSS56P0CW18 603 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PFKLP17858 780 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CD6P30203 668 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CCR1P32246 355 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CD86P42081 329 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 NEK2P51955 445 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 NFKB2Q00653 900 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 RBBP7Q16576 425 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SPATS1Q496A3 300 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 DESI1Q6ICB0 168 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SPATC1Q76KD6 591 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SYVN1Q86TM6 617 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 LGALS12Q96DT0 336 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ASB2Q96Q27 587 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 MGEA5O60502 916 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 ASGR1P07306 291 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PIRTP0C851 137 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 VAC14Q08AM6 782 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 PRKG2Q13237 762 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI1-201ENST00000257552 CAMK2BQ13554 666 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms