RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 KCNMB2Q9Y691 235 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC66A2RUB6 948 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 TLCD2A6NGC4 264 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 C21orf140B9A014 251 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 KCNN4O15554 427 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 CREG1O75629 220 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 PSMB4P28070 264 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 PTPN7P35236 360 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 RWDD2BP57060 319 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 HSD11B2P80365 405 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 DNASE1L3Q13609 305 aa20.56■□□□□ 0.88
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NEDD8-201ENST00000250495 CFAP206Q8IYR0 622 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 ULK4Q96C45 1275 aa20.56■□□□□ 0.88
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NEDD8-201ENST00000250495 CRLS1Q9UJA2 301 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 PIPSLA2A3N6 862 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 AGAP14A8MT82 685 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 PJA2O43164 708 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 TJP3O95049 919 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 NDUFS1P28331 727 aa20.55■□□□□ 0.88
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NEDD8-201ENST00000250495 XIAPP98170 497 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 KRT33BQ14525 404 aa20.55■□□□□ 0.88
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NEDD8-201ENST00000250495 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.55■□□□□ 0.88
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NEDD8-201ENST00000250495 D2HGDHQ8N465 521 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 SEC14L1Q92503 715 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 SPATA13Q96N96 652 aa20.55■□□□□ 0.88
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NEDD8-201ENST00000250495 TWSG1Q9GZX9 223 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 EPN3Q9H201 632 aa20.55■□□□□ 0.88
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NEDD8-201ENST00000250495 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 CFAP99D6REC4 459 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 MKRN2OSH3BPM6 223 aa20.54■□□□□ 0.88
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NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 POLBP06746 335 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 EBLN1P0CF75 366 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 SNX20Q7Z614 316 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.54■□□□□ 0.88
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NEDD8-201ENST00000250495 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 CT55Q8WUE5 264 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 COPS8Q99627 209 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 GPR87Q9BY21 358 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa20.53■□□□□ 0.88
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NEDD8-201ENST00000250495 OR6C74A6NCV1 312 aa20.53■□□□□ 0.88
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NEDD8-201ENST00000250495 NTRK1P04629 796 aa20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 FURINP09958 794 aa20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 ITGALP20701 1170 aa20.53■□□□□ 0.88
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NEDD8-201ENST00000250495 PRKAA1Q13131 559 aa20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 OLIG2Q13516 323 aa20.53■□□□□ 0.88
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NEDD8-201ENST00000250495 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 KCND1Q9NSA2 647 aa20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 RCCD1A6NED2 376 aa20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 PRLHRP49683 370 aa20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 RPS15P62841 145 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 KLRB1Q12918 225 aa20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 GPR33Q49SQ1 333 aa20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 NAT14Q8WUY8 206 aa20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.52■□□□□ 0.88
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