RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 NIPSNAP2O75323 286 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 KRT37O76014 449 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ANXA6P08133 673 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 BMPR2Q13873 1038 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 LGSNQ5TDP6 509 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TAF8Q7Z7C8 310 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 NAXDQ8IW45 347 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SLC25A45Q8N413 288 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 RHBDD1Q8TEB9 315 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 GSDMCQ9BYG8 508 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TBK1Q9UHD2 729 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 VWA7Q9Y334 891 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CEP250Q9BV73 2442 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 IQCF5A8MTL0 148 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SH3BP5O60239 455 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SDHBP21912 280 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CD9P21926 228 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 POU4F1Q01851 419 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 DEFB133Q30KQ1 61 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 MROH9Q5TGP6 573 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 DBX2Q6ZNG2 339 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 C11orf96Q7Z7L8 435 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 KCNJ9Q92806 393 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 MTBPQ96DY7 904 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ELMO2Q96JJ3 720 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 PANX3Q96QZ0 392 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM49D1C9J1S8 452 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 LMO7DNF2Z398 122 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 KMOO15229 486 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 FTH1P02794 183 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ACP5P13686 325 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 FDXRP22570 491 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CDKN2DP55273 166 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CBX1P83916 185 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CTBSQ01459 385 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 LRP8Q14114 963 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TMED2Q15363 201 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 INSCQ1MX18 579 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CYP4X1Q8N118 509 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 EID2Q8N6I1 236 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 MZB1Q8WU39 189 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 OLFM1Q99784 485 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 DUSP23Q9BVJ7 150 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TSSK1BQ9BXA7 367 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 NLGN3Q9NZ94 848 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SLC39A10Q9ULF5 831 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 BTBD3Q9Y2F9 522 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 VPS26AO75436 327 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM16O95361 564 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 GSTM1P09488 218 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CHRM3P20309 590 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 NR1D1P20393 614 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 AK4P27144 223 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ACTR1BP42025 376 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TAS2R39P59534 338 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ACTR1AP61163 376 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 GSTM4Q03013 218 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJC3Q13217 504 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 USP10Q14694 798 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SLC30A9Q6PML9 568 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 OR4C6Q8NH72 309 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CCL4L1Q8NHW4 92 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 GPBAR1Q8TDU6 330 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ISL2Q96A47 359 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CCM2Q9BSQ5 444 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SLC32A1Q9H598 525 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CAB39LQ9H9S4 337 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 LATS2Q9NRM7 1088 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TAS2R13Q9NYV9 303 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 E5RI56 91 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TPP1O14773 563 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 POP7O75817 140 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ITGB6P18564 788 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SAT1P21673 171 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CSRP3P50461 194 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CLCN7P51798 805 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 LVRNQ6Q4G3 990 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TIFABQ6ZNK6 161 aa19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms