RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 E7ESA3 106 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 S1PR4O95977 384 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 F7P08709 466 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 PGAM1P18669 254 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 PAMP19021 973 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 OGNP20774 298 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 CCR7P32248 378 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 HALP42357 657 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 PREPP48147 710 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 GPLD1P80108 840 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 GPR18Q14330 331 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 CRYMQ14894 314 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 RTP5Q14D33 572 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 CTSL3PQ5NE16 218 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 MRNIPQ6NTE8 343 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 AVL9Q8NBF6 648 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 GRAMD1AQ96CP6 724 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 CXorf40BQ96DE9 158 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 TCF12Q99081 682 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 CARD6Q9BX69 1037 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 NRSN2Q9GZP1 204 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 DPH5Q9H2P9 285 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 VPS37BQ9H9H4 285 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 TMEM9Q9P0T7 183 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 PDP2Q9P2J9 529 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 PMS2P1A4D2B8 440 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 NDUFS3O75489 264 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 FTH1P02794 183 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 CCKBRP32239 447 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 ELK3P41970 407 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 EPHA4P54764 986 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 RPA4Q13156 261 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 LONRF1Q17RB8 773 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 PIM3Q86V86 326 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 PDIK1LQ8N165 341 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 KRT222Q8N1A0 295 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 C12orf66Q96MD2 445 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 CDYLQ9Y232 598 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 GPC4O75487 556 aa21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ITGB6P18564 788 aa21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ACADLP28330 430 aa21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 INHBCP55103 352 aa21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ADARP55265 1226 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CTBP1Q13363 440 aa21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 HIF1AQ16665 826 aa21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TRIM48Q8IWZ4 208 aa21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ELMO1Q92556 727 aa21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 LRRC1Q9BTT6 524 aa21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ZW10O43264 779 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 SLC35G4P0C7Q5 338 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 AOAHP28039 575 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CD151P48509 253 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 LIMK2P53671 638 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ARL4CP56559 192 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TUBB2AQ13885 445 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 BRD3Q15059 726 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 STEAP4Q687X5 459 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ZNF470Q6ECI4 717 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TMEM71Q6P5X7 295 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 UNC5AQ6ZN44 842 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 LRRC6Q86X45 466 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 VRK3Q8IV63 474 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 MMGT1Q8N4V1 131 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 BBOF1Q8ND07 529 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 OR4D9Q8NGE8 314 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 OR10G6Q8NH81 332 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 MDM1Q8TC05 714 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ART4Q93070 314 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 LRRC39Q96DD0 335 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 NAT9Q9BTE0 207 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TUBB2BQ9BVA1 445 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CHMP2BQ9UQN3 213 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TTC4O95801 387 aa21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms